Detalhe da pesquisa
1.
Gene Expression Changes and Community Turnover Differentially Shape the Global Ocean Metatranscriptome.
Cell
; 179(5): 1068-1083.e21, 2019 Nov 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31730850
2.
Functional and evolutionary significance of unknown genes from uncultivated taxa.
Nature
; 626(7998): 377-384, 2024 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38109938
3.
Towards the biogeography of prokaryotic genes.
Nature
; 601(7892): 252-256, 2022 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34912116
4.
eggNOG 6.0: enabling comparative genomics across 12 535 organisms.
Nucleic Acids Res
; 51(D1): D389-D394, 2023 01 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36399505
5.
proGenomes3: approaching one million accurately and consistently annotated high-quality prokaryotic genomes.
Nucleic Acids Res
; 51(D1): D760-D766, 2023 01 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36408900
6.
Structure and function of the global topsoil microbiome.
Nature
; 560(7717): 233-237, 2018 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30069051
7.
GeCoViz: genomic context visualisation of prokaryotic genes from a functional and evolutionary perspective.
Nucleic Acids Res
; 50(W1): W352-W357, 2022 07 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35639770
8.
PhyloCloud: an online platform for making sense of phylogenomic data.
Nucleic Acids Res
; 50(W1): W577-W582, 2022 07 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35544233
9.
eggNOG-mapper v2: Functional Annotation, Orthology Assignments, and Domain Prediction at the Metagenomic Scale.
Mol Biol Evol
; 38(12): 5825-5829, 2021 12 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34597405
10.
proGenomes2: an improved database for accurate and consistent habitat, taxonomic and functional annotations of prokaryotic genomes.
Nucleic Acids Res
; 48(D1): D621-D625, 2020 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31647096
11.
The Quest for Orthologs benchmark service and consensus calls in 2020.
Nucleic Acids Res
; 48(W1): W538-W545, 2020 07 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32374845
12.
eggNOG 5.0: a hierarchical, functionally and phylogenetically annotated orthology resource based on 5090 organisms and 2502 viruses.
Nucleic Acids Res
; 47(D1): D309-D314, 2019 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30418610
13.
STRING v11: protein-protein association networks with increased coverage, supporting functional discovery in genome-wide experimental datasets.
Nucleic Acids Res
; 47(D1): D607-D613, 2019 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30476243
14.
Advances and Applications in the Quest for Orthologs.
Mol Biol Evol
; 36(10): 2157-2164, 2019 10 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31241141
15.
Antibiotics-induced monodominance of a novel gut bacterial order.
Gut
; 68(10): 1781-1790, 2019 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30658995
16.
Standardized benchmarking in the quest for orthologs.
Nat Methods
; 13(5): 425-30, 2016 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27043882
17.
Gearing up to handle the mosaic nature of life in the quest for orthologs.
Bioinformatics
; 34(2): 323-329, 2018 Jan 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28968857
18.
proGenomes: a resource for consistent functional and taxonomic annotations of prokaryotic genomes.
Nucleic Acids Res
; 45(D1): D529-D534, 2017 01 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28053165
19.
A Critical Review on the Use of Support Values in Tree Viewers and Bioinformatics Toolkits.
Mol Biol Evol
; 34(6): 1535-1542, 2017 06 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28369572
20.
Fast Genome-Wide Functional Annotation through Orthology Assignment by eggNOG-Mapper.
Mol Biol Evol
; 34(8): 2115-2122, 2017 08 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28460117