Detalhe da pesquisa
1.
Structure of the OMEGA nickase IsrB in complex with ωRNA and target DNA.
Nature
; 610(7932): 575-581, 2022 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36224386
2.
Cryo-EM structures of full-length Tetrahymena ribozyme at 3.1 Å resolution.
Nature
; 596(7873): 603-607, 2021 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34381213
3.
A Quantitative and Predictive Model for RNA Binding by Human Pumilio Proteins.
Mol Cell
; 74(5): 966-981.e18, 2019 06 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31078383
4.
A unified mechanism for intron and exon definition and back-splicing.
Nature
; 573(7774): 375-380, 2019 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31485080
5.
Topological crossing in the misfolded Tetrahymena ribozyme resolved by cryo-EM.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 119(37): e2209146119, 2022 09 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36067294
6.
DAPTEV: Deep aptamer evolutionary modelling for COVID-19 drug design.
PLoS Comput Biol
; 19(7): e1010774, 2023 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37406007
7.
Architecture of an HIV-1 reverse transcriptase initiation complex.
Nature
; 557(7703): 118-122, 2018 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29695867
8.
Accelerated cryo-EM-guided determination of three-dimensional RNA-only structures.
Nat Methods
; 17(7): 699-707, 2020 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32616928
9.
Macromolecular modeling and design in Rosetta: recent methods and frameworks.
Nat Methods
; 17(7): 665-680, 2020 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32483333
10.
Blind tests of RNA-protein binding affinity prediction.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 116(17): 8336-8341, 2019 04 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30962376
11.
De novo computational RNA modeling into cryo-EM maps of large ribonucleoprotein complexes.
Nat Methods
; 15(11): 947-954, 2018 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30377372
12.
RNA 3D structure prediction guided by independent folding of homologous sequences.
BMC Bioinformatics
; 20(1): 512, 2019 Oct 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31640563
13.
Single-molecule FRET-Rosetta reveals RNA structural rearrangements during human telomerase catalysis.
RNA
; 23(2): 175-188, 2017 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28096444
14.
RNA-Puzzles Round III: 3D RNA structure prediction of five riboswitches and one ribozyme.
RNA
; 23(5): 655-672, 2017 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28138060
15.
Blind tests of RNA nearest-neighbor energy prediction.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 113(30): 8430-5, 2016 07 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27402765
16.
Accelerated molecular dynamics simulations of ligand binding to a muscarinic G-protein-coupled receptor.
Q Rev Biophys
; 48(4): 479-87, 2015 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26537408
17.
Auto-DRRAFTER: Automated RNA Modeling Based on Cryo-EM Density.
Methods Mol Biol
; 2568: 193-211, 2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36227570
18.
Learning cis-regulatory principles of ADAR-based RNA editing from CRISPR-mediated mutagenesis.
Nat Commun
; 12(1): 2165, 2021 04 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33846332
19.
Distinct Conformational States Underlie Pausing during Initiation of HIV-1 Reverse Transcription.
J Mol Biol
; 432(16): 4499-4522, 2020 07 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32512005
20.
Sampling Native-like Structures of RNA-Protein Complexes through Rosetta Folding and Docking.
Structure
; 27(1): 140-151.e5, 2019 01 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30416038