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1.
PLoS Comput Biol ; 18(11): e1010663, 2022 11.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36355866

RESUMO

BIPS (Build Phage ImmunoPrecipitation Sequencing library) is a software that converts a list of proteins into a custom DNA oligonucleotide library for the PhIP-Seq system. The tool creates constant-length oligonucleotides with internal barcodes, while maintaining the original length of the peptide. This allows using large libraries, of hundreds of thousands of oligonucleotides, while saving on the costs of sequencing and maintaining the accuracy of oligonucleotide reads identification. BIPS is available under GNU public license from: https://github.com/kalkairis/BuildPhIPSeqLibrary.


Assuntos
Bacteriófagos , Bacteriófagos/genética , Bacteriófagos/metabolismo , Biblioteca Gênica , Imunoprecipitação , Software , Oligonucleotídeos/genética , Oligonucleotídeos/metabolismo , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala
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