Detalhe da pesquisa
1.
OrthoDB v11: annotation of orthologs in the widest sampling of organismal diversity.
Nucleic Acids Res
; 51(D1): D445-D451, 2023 01 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36350662
2.
OrthoDB in 2020: evolutionary and functional annotations of orthologs.
Nucleic Acids Res
; 49(D1): D389-D393, 2021 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33196836
3.
OrthoDB v10: sampling the diversity of animal, plant, fungal, protist, bacterial and viral genomes for evolutionary and functional annotations of orthologs.
Nucleic Acids Res
; 47(D1): D807-D811, 2019 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30395283
4.
BUSCO Applications from Quality Assessments to Gene Prediction and Phylogenomics.
Mol Biol Evol
; 35(3): 543-548, 2018 Mar 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29220515
5.
OrthoDB v9.1: cataloging evolutionary and functional annotations for animal, fungal, plant, archaeal, bacterial and viral orthologs.
Nucleic Acids Res
; 45(D1): D744-D749, 2017 01 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27899580
6.
ACI-1 beta-lactamase is widespread across human gut microbiomes in Negativicutes due to transposons harboured by tailed prophages.
Environ Microbiol
; 20(6): 2288-2300, 2018 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30014616
7.
OrthoDB v8: update of the hierarchical catalog of orthologs and the underlying free software.
Nucleic Acids Res
; 43(Database issue): D250-6, 2015 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25428351
8.
Social insect genomes exhibit dramatic evolution in gene composition and regulation while preserving regulatory features linked to sociality.
Genome Res
; 23(8): 1235-47, 2013 Aug.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23636946
9.
BUSCO: assessing genome assembly and annotation completeness with single-copy orthologs.
Bioinformatics
; 31(19): 3210-2, 2015 Oct 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26059717
10.
OrthoDB: a hierarchical catalog of animal, fungal and bacterial orthologs.
Nucleic Acids Res
; 41(Database issue): D358-65, 2013 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23180791
11.
OrthoDB: the hierarchical catalog of eukaryotic orthologs in 2011.
Nucleic Acids Res
; 39(Database issue): D283-8, 2011 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20972218
12.
Genome sequences of the human body louse and its primary endosymbiont provide insights into the permanent parasitic lifestyle.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 107(27): 12168-73, 2010 Jul 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20566863
13.
Mapping of small RNAs in the human ENCODE regions.
Am J Hum Genet
; 82(4): 971-81, 2008 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18394580
14.
miROrtho: computational survey of microRNA genes.
Nucleic Acids Res
; 37(Database issue): D111-7, 2009 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18927110
15.
OrthoDB: the hierarchical catalog of eukaryotic orthologs.
Nucleic Acids Res
; 36(Database issue): D271-5, 2008 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-17947323
16.
Increase of functional diversity by alternative splicing.
Trends Genet
; 19(3): 124-8, 2003 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-12615003
17.
Correlating traits of gene retention, sequence divergence, duplicability and essentiality in vertebrates, arthropods, and fungi.
Genome Biol Evol
; 3: 75-86, 2011.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21148284
18.
The ecoresponsive genome of Daphnia pulex.
Science
; 331(6017): 555-61, 2011 Feb 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21292972
19.
The bovine lactation genome: insights into the evolution of mammalian milk.
Genome Biol
; 10(4): R43, 2009.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19393040
20.
Quantification of ortholog losses in insects and vertebrates.
Genome Biol
; 8(11): R242, 2007.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18021399