Detalhe da pesquisa
1.
Minimally overlapping words for sequence similarity search.
Bioinformatics
; 36(22-23): 5344-5350, 2021 Apr 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33346833
2.
Evolution of biosequence search algorithms: a brief survey.
Bioinformatics
; 35(19): 3547-3552, 2019 10 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30994912
3.
RNF: a general framework to evaluate NGS read mappers.
Bioinformatics
; 32(1): 136-9, 2016 Jan 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26353839
4.
Spaced seeds improve k-mer-based metagenomic classification.
Bioinformatics
; 31(22): 3584-92, 2015 Nov 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26209798
5.
Efficient and Robust Search of Microbial Genomes via Phylogenetic Compression.
bioRxiv
; 2023 Apr 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37131636
6.
Set-Min Sketch: A Probabilistic Map for Power-Law Distributions with Application to k-Mer Annotation.
J Comput Biol
; 29(2): 140-154, 2022 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35049334
7.
Space-efficient representation of genomic k-mer count tables.
Algorithms Mol Biol
; 17(1): 5, 2022 Mar 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35317833
8.
Simplitigs as an efficient and scalable representation of de Bruijn graphs.
Genome Biol
; 22(1): 96, 2021 04 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33823902
9.
Diversity of monomers in nonribosomal peptides: towards the prediction of origin and biological activity.
J Bacteriol
; 192(19): 5143-50, 2010 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20693331
10.
Reconsidering the significance of genomic word frequencies.
Trends Genet
; 23(11): 543-6, 2007 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-17964682
11.
NORINE: a database of nonribosomal peptides.
Nucleic Acids Res
; 36(Database issue): D326-31, 2008 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-17913739
12.
Rapid inference of antibiotic resistance and susceptibility by genomic neighbour typing.
Nat Microbiol
; 5(3): 455-464, 2020 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32042129
13.
Structural pattern matching of nonribosomal peptides.
BMC Struct Biol
; 9: 15, 2009 Mar 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19296847
14.
SIGffRid: a tool to search for sigma factor binding sites in bacterial genomes using comparative approach and biologically driven statistics.
BMC Bioinformatics
; 9: 73, 2008 Jan 31.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18237374
15.
Optimal neighborhood indexing for protein similarity search.
BMC Bioinformatics
; 9: 534, 2008 Dec 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19087280
16.
Diversity and structure of PIF/Harbinger-like elements in the genome of Medicago truncatula.
BMC Genomics
; 8: 409, 2007 Nov 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-17996080
17.
YASS: enhancing the sensitivity of DNA similarity search.
Nucleic Acids Res
; 33(Web Server issue): W540-3, 2005 Jul 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-15980530
18.
A unifying framework for seed sensitivity and its application to subset seeds.
J Bioinform Comput Biol
; 4(2): 553-69, 2006 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-16819802
19.
mreps: Efficient and flexible detection of tandem repeats in DNA.
Nucleic Acids Res
; 31(13): 3672-8, 2003 Jul 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-12824391
20.
Multiseed lossless filtration.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; 2(1): 51-61, 2005.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-17044164