Detalhe da pesquisa
1.
Obtaining genetics insights from deep learning via explainable artificial intelligence.
Nat Rev Genet
; 24(2): 125-137, 2023 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36192604
2.
Robust chromatin state annotation.
Genome Res
; 34(3): 469-483, 2024 Apr 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38514204
3.
SigTools: exploratory visualization for genomic signals.
Bioinformatics
; 38(4): 1126-1128, 2022 01 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34718413
4.
Continuous chromatin state feature annotation of the human epigenome.
Bioinformatics
; 38(11): 3029-3036, 2022 05 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35451453
5.
Automated identification of maximal differential cell populations in flow cytometry data.
Cytometry A
; 101(2): 177-184, 2022 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34559446
6.
Segmentation and genome annotation algorithms for identifying chromatin state and other genomic patterns.
PLoS Comput Biol
; 17(10): e1009423, 2021 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34648491
7.
Machine learning applications in genetics and genomics.
Nat Rev Genet
; 16(6): 321-32, 2015 Jun.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25948244
8.
Comparative analysis of metazoan chromatin organization.
Nature
; 512(7515): 449-52, 2014 Aug 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25164756
9.
Segway 2.0: Gaussian mixture models and minibatch training.
Bioinformatics
; 34(4): 669-671, 2018 02 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29028889
10.
Choosing non-redundant representative subsets of protein sequence data sets using submodular optimization.
Proteins
; 86(4): 454-466, 2018 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29345009
11.
Joint annotation of chromatin state and chromatin conformation reveals relationships among domain types and identifies domains of cell-type-specific expression.
Genome Res
; 25(4): 544-57, 2015 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25677182
12.
Latent Representation of the Human Pan-Celltype Epigenome Through a Deep Recurrent Neural Network.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; 19(4): 2313-2323, 2022.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34043510
13.
Learning representations of chromatin contacts using a recurrent neural network identifies genomic drivers of conformation.
Nat Commun
; 13(1): 3704, 2022 06 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35764630
14.
DEEMD: Drug Efficacy Estimation Against SARS-CoV-2 Based on Cell Morphology With Deep Multiple Instance Learning.
IEEE Trans Med Imaging
; 41(11): 3128-3145, 2022 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35622798
15.
A unified encyclopedia of human functional DNA elements through fully automated annotation of 164 human cell types.
Genome Biol
; 20(1): 180, 2019 08 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31462275
16.
PREDICTD PaRallel Epigenomics Data Imputation with Cloud-based Tensor Decomposition.
Nat Commun
; 9(1): 1402, 2018 04 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29643364
17.
Choosing panels of genomics assays using submodular optimization.
Genome Biol
; 17(1): 229, 2016 11 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27846892
18.
Distinct epigenetic features of differentiation-regulated replication origins.
Epigenetics Chromatin
; 9: 18, 2016.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27168766