Detalhe da pesquisa
1.
The ProteomeXchange consortium at 10 years: 2023 update.
Nucleic Acids Res
; 51(D1): D1539-D1548, 2023 01 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36370099
2.
A Workflow for Improved Analysis of Cross-Linking Mass Spectrometry Data Integrating Parallel Accumulation-Serial Fragmentation with MeroX and Skyline.
Anal Chem
; 96(19): 7373-7379, 2024 May 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38696819
3.
MSstats Version 4.0: Statistical Analyses of Quantitative Mass Spectrometry-Based Proteomic Experiments with Chromatography-Based Quantification at Scale.
J Proteome Res
; 22(5): 1466-1482, 2023 05 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37018319
4.
TurnoveR: A Skyline External Tool for Analysis of Protein Turnover in Metabolic Labeling Studies.
J Proteome Res
; 22(2): 311-322, 2023 02 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36165806
5.
Evaluating the Performance of the Astral Mass Analyzer for Quantitative Proteomics Using Data-Independent Acquisition.
J Proteome Res
; 22(10): 3290-3300, 2023 10 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37683181
6.
Avant-garde: an automated data-driven DIA data curation tool.
Nat Methods
; 17(12): 1237-1244, 2020 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33199889
7.
Skyline Batch: An Intuitive User Interface for Batch Processing with Skyline.
J Proteome Res
; 21(1): 289-294, 2022 01 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34919405
8.
Development and Application of Multidimensional Lipid Libraries to Investigate Lipidomic Dysregulation Related to Smoke Inhalation Injury Severity.
J Proteome Res
; 21(1): 232-242, 2022 01 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34874736
9.
Selection of Features with Consistent Profiles Improves Relative Protein Quantification in Mass Spectrometry Experiments.
Mol Cell Proteomics
; 19(6): 944-959, 2020 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32234965
10.
The ProteomeXchange consortium in 2020: enabling 'big data' approaches in proteomics.
Nucleic Acids Res
; 48(D1): D1145-D1152, 2020 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31686107
11.
METLIN-CCS: an ion mobility spectrometry collision cross section database.
Nat Methods
; 20(12): 1836-1837, 2023 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37932399
12.
Audit logs to enforce document integrity in Skyline and Panorama.
Bioinformatics
; 36(15): 4366-4368, 2020 08 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32467974
13.
The Skyline ecosystem: Informatics for quantitative mass spectrometry proteomics.
Mass Spectrom Rev
; 39(3): 229-244, 2020 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28691345
14.
Skyline for Small Molecules: A Unifying Software Package for Quantitative Metabolomics.
J Proteome Res
; 19(4): 1447-1458, 2020 04 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31984744
15.
Statistical control of peptide and protein error rates in large-scale targeted data-independent acquisition analyses.
Nat Methods
; 14(9): 921-927, 2017 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28825704
16.
Panorama Public: A Public Repository for Quantitative Data Sets Processed in Skyline.
Mol Cell Proteomics
; 17(6): 1239-1244, 2018 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29487113
17.
Standardization of PGC-LC-MS-based glycomics for sample specific glycotyping.
Analyst
; 144(11): 3601-3612, 2019 Jun 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31065629
18.
MSstatsQC: Longitudinal System Suitability Monitoring and Quality Control for Targeted Proteomic Experiments.
Mol Cell Proteomics
; 16(7): 1335-1347, 2017 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28483925
19.
ABRF Proteome Informatics Research Group (iPRG) 2015 Study: Detection of Differentially Abundant Proteins in Label-Free Quantitative LC-MS/MS Experiments.
J Proteome Res
; 16(2): 945-957, 2017 02 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27990823
20.
Peptide-Centric Proteome Analysis: An Alternative Strategy for the Analysis of Tandem Mass Spectrometry Data.
Mol Cell Proteomics
; 14(9): 2301-7, 2015 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26217018