Detalhe da pesquisa
1.
Global RNA interactome of Salmonella discovers a 5' UTR sponge for the MicF small RNA that connects membrane permeability to transport capacity.
Mol Cell
; 82(3): 629-644.e4, 2022 02 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35063132
2.
Global Mapping of Small RNA-Target Interactions in Bacteria.
Mol Cell
; 63(5): 884-97, 2016 09 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27588604
3.
Common Adaptive Strategies Underlie Within-Host Evolution of Bacterial Pathogens.
Mol Biol Evol
; 38(3): 1101-1121, 2021 03 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33118035
4.
Assessing the functional association of intronic miRNAs with their host genes.
RNA
; 24(8): 991-1004, 2018 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29752351
5.
In vivo cleavage rules and target repertoire of RNase III in Escherichia coli.
Nucleic Acids Res
; 46(19): 10380-10394, 2018 11 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30113670
6.
A defense-offense multi-layered regulatory switch in a pathogenic bacterium.
Nucleic Acids Res
; 43(3): 1357-69, 2015 Feb 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25628364
7.
Evolutionary patterns of Escherichia coli small RNAs and their regulatory interactions.
RNA
; 20(7): 994-1003, 2014 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24865611
8.
Auxiliary tRNAs: large-scale analysis of tRNA genes reveals patterns of tRNA repertoire dynamics.
Nucleic Acids Res
; 42(10): 6552-66, 2014 Jun.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24782525
9.
In vivo cleavage rules and target repertoire of RNase III in Escherichia coli.
Nucleic Acids Res
; 46(19): 10530-10531, 2018 11 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30184218
10.
Global regulation of transcription by a small RNA: a quantitative view.
Biophys J
; 106(5): 1205-14, 2014 Mar 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24606944
11.
Interactions between distant ceRNAs in regulatory networks.
Biophys J
; 106(10): 2254-66, 2014 May 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24853754
12.
A genome-wide view of the expression and processing patterns of Thermus thermophilus HB8 CRISPR RNAs.
RNA
; 18(4): 783-94, 2012 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22355165
13.
In vivo mapping of RNA-RNA interactions in Staphylococcus aureus using the endoribonuclease III.
Methods
; 63(2): 135-43, 2013 Sep 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23851283
14.
Codon usage bias in prokaryotic pyrimidine-ending codons is associated with the degeneracy of the encoded amino acids.
Nucleic Acids Res
; 40(15): 7074-83, 2012 Aug.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22581775
15.
A functional selection model explains evolutionary robustness despite plasticity in regulatory networks.
Mol Syst Biol
; 8: 619, 2012.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23089682
16.
A dynamic view of domain-motif interactions.
PLoS Comput Biol
; 8(1): e1002341, 2012 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22253583
17.
RepTar: a database of predicted cellular targets of host and viral miRNAs.
Nucleic Acids Res
; 39(Database issue): D188-94, 2011 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21149264
18.
Legionella pneumophila 6S RNA optimizes intracellular multiplication.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 107(16): 7533-8, 2010 Apr 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20368425
19.
Convergent Within-Host Adaptation of Pseudomonas aeruginosa through the Transcriptional Regulatory Network.
mSystems
; 8(2): e0002423, 2023 04 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36975785
20.
TRS: a method for determining transcript termini from RNAtag-seq sequencing data.
Nat Commun
; 14(1): 7843, 2023 Nov 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38030608