Detalhe da pesquisa
1.
Improved discovery of RNA-binding protein binding sites in eCLIP data using DEWSeq.
Nucleic Acids Res
; 52(1): e1, 2024 Jan 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37962298
2.
MutaRNA: analysis and visualization of mutation-induced changes in RNA structure.
Nucleic Acids Res
; 48(W1): W287-W291, 2020 07 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32392303
3.
The locality dilemma of Sankoff-like RNA alignments.
Bioinformatics
; 36(Suppl_1): i242-i250, 2020 07 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32657398
4.
Structure-aware machine learning identifies microRNAs operating as Toll-like receptor 7/8 ligands.
RNA Biol
; 18(sup1): 268-277, 2021 10 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34241565
5.
ShaKer: RNA SHAPE prediction using graph kernel.
Bioinformatics
; 35(14): i354-i359, 2019 07 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31510707
6.
Integration of accessibility data from structure probing into RNA-RNA interaction prediction.
Bioinformatics
; 35(16): 2862-2864, 2019 08 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30590479
7.
Freiburg RNA tools: a central online resource for RNA-focused research and teaching.
Nucleic Acids Res
; 46(W1): W25-W29, 2018 07 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29788132
8.
RNAscClust: clustering RNA sequences using structure conservation and graph based motifs.
Bioinformatics
; 33(14): 2089-2096, 2017 Jul 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28334186
9.
SPARSE: quadratic time simultaneous alignment and folding of RNAs without sequence-based heuristics.
Bioinformatics
; 31(15): 2489-96, 2015 Aug 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25838465
10.
How to do RNA-RNA Interaction Prediction? A Use-Case Driven Handbook Using IntaRNA.
Methods Mol Biol
; 2726: 209-234, 2024.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38780733
11.
Freely accessible ready to use global infrastructure for SARS-CoV-2 monitoring.
bioRxiv
; 2021 Mar 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33791701
12.
MicroRNA-100-5p and microRNA-298-5p released from apoptotic cortical neurons are endogenous Toll-like receptor 7/8 ligands that contribute to neurodegeneration.
Mol Neurodegener
; 16(1): 80, 2021 11 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34838071
13.
Fast and accurate structure probability estimation for simultaneous alignment and folding of RNAs with Markov chains.
Algorithms Mol Biol
; 15(1): 19, 2020 Nov 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33292340
14.
NanoGalaxy: Nanopore long-read sequencing data analysis in Galaxy.
Gigascience
; 9(10)2020 10 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33068114
15.
GraphClust2: Annotation and discovery of structured RNAs with scalable and accessible integrative clustering.
Gigascience
; 8(12)2019 12 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31808801
16.
A pan-cancer analysis of synonymous mutations.
Nat Commun
; 10(1): 2569, 2019 06 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31189880
17.
Ready-to-use public infrastructure for global SARS-CoV-2 monitoring.
Nat Biotechnol
; 39(10): 1178-1179, 2021 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34588690