Detalhe da pesquisa
1.
The tidyomics ecosystem: enhancing omic data analyses.
Nat Methods
; 2024 Jun 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38877315
2.
ReUseData: an R/Bioconductor tool for reusable and reproducible genomic data management.
BMC Bioinformatics
; 25(1): 8, 2024 Jan 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38172657
3.
RaggedExperiment: the missing link between genomic ranges and matrices in Bioconductor.
Bioinformatics
; 39(6)2023 06 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37208161
4.
Curated single cell multimodal landmark datasets for R/Bioconductor.
PLoS Comput Biol
; 19(8): e1011324, 2023 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37624866
5.
Orchestrating single-cell analysis with Bioconductor.
Nat Methods
; 17(2): 137-145, 2020 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31792435
6.
Publisher Correction: Orchestrating single-cell analysis with Bioconductor.
Nat Methods
; 17(2): 242, 2020 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31827272
7.
Toward a gold standard for benchmarking gene set enrichment analysis.
Brief Bioinform
; 22(1): 545-556, 2021 01 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32026945
8.
Bioconductor toolchain for reproducible bioinformatics pipelines using Rcwl and RcwlPipelines.
Bioinformatics
; 37(19): 3351-3352, 2021 Oct 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33772584
9.
Tximeta: Reference sequence checksums for provenance identification in RNA-seq.
PLoS Comput Biol
; 16(2): e1007664, 2020 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32097405
10.
Open-source Software Sustainability Models: Initial White Paper From the Informatics Technology for Cancer Research Sustainability and Industry Partnership Working Group.
J Med Internet Res
; 23(12): e20028, 2021 12 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34860667
11.
gwasurvivr: an R package for genome-wide survival analysis.
Bioinformatics
; 35(11): 1968-1970, 2019 06 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30395168
12.
Orchestrating high-throughput genomic analysis with Bioconductor.
Nat Methods
; 12(2): 115-21, 2015 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25633503
13.
Public data and open source tools for multi-assay genomic investigation of disease.
Brief Bioinform
; 17(4): 603-15, 2016 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26463000
14.
Accessible, curated metagenomic data through ExperimentHub.
Nat Methods
; 14(11): 1023-1024, 2017 10 31.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29088129
15.
VariantAnnotation: a Bioconductor package for exploration and annotation of genetic variants.
Bioinformatics
; 30(14): 2076-8, 2014 Jul 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24681907
16.
Relationship of Specific Bacteria in the Cervical and Vaginal Microbiotas With Cervicitis.
Sex Transm Dis
; 42(9): 475-481, 2015 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26267872
17.
Scalable Genomics with R and Bioconductor.
Stat Sci
; 29(2): 214-226, 2014 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28018047
18.
Software for computing and annotating genomic ranges.
PLoS Comput Biol
; 9(8): e1003118, 2013.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23950696
19.
AnVILWorkflow: A runnable workflow package for Cloud-implemented bioinformatics analysis pipelines.
Res Sq
; 2024 May 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38798429
20.
The tidyomics ecosystem: Enhancing omic data analyses.
bioRxiv
; 2024 May 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38826347