Detalhe da pesquisa
1.
Accurate de novo design of membrane-traversing macrocycles.
Cell
; 185(19): 3520-3532.e26, 2022 09 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36041435
2.
Combining machine learning with structure-based protein design to predict and engineer post-translational modifications of proteins.
PLoS Comput Biol
; 20(3): e1011939, 2024 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38484014
3.
De novo design of bioactive protein switches.
Nature
; 572(7768): 205-210, 2019 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31341284
4.
Programmable design of orthogonal protein heterodimers.
Nature
; 565(7737): 106-111, 2019 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30568301
5.
Computationally designed peptide macrocycle inhibitors of New Delhi metallo-ß-lactamase 1.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 118(12)2021 03 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33723038
6.
XENet: Using a new graph convolution to accelerate the timeline for protein design on quantum computers.
PLoS Comput Biol
; 17(9): e1009037, 2021 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34570773
7.
Accurate de novo design of hyperstable constrained peptides.
Nature
; 538(7625): 329-335, 2016 Oct 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27626386
8.
Better together: Elements of successful scientific software development in a distributed collaborative community.
PLoS Comput Biol
; 16(5): e1007507, 2020 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32365137
9.
MHCEpitopeEnergy, a Flexible Rosetta-Based Biotherapeutic Deimmunization Platform.
J Chem Inf Model
; 61(5): 2368-2382, 2021 05 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33900750
10.
De novo design of covalently constrained mesosize protein scaffolds with unique tertiary structures.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 114(41): 10852-10857, 2017 10 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28973862
11.
A systematic study of minima in alanine dipeptide.
J Comput Chem
; 40(2): 297-309, 2019 01 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30368851
12.
Protein misfolding in the late-onset neurodegenerative diseases: common themes and the unique case of amyotrophic lateral sclerosis.
Proteins
; 81(8): 1285-303, 2013 Aug.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23508986
13.
Computational design of an unnatural amino acid dependent metalloprotein with atomic level accuracy.
J Am Chem Soc
; 135(36): 13393-9, 2013 Sep 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23924187
14.
Prion disease susceptibility is affected by beta-structure folding propensity and local side-chain interactions in PrP.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 107(46): 19808-13, 2010 Nov 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21041683
15.
How to Design Peptides.
Methods Mol Biol
; 2597: 187-216, 2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36374423
16.
CCM3/PDCD10 heterodimerizes with germinal center kinase III (GCKIII) proteins using a mechanism analogous to CCM3 homodimerization.
J Biol Chem
; 286(28): 25056-64, 2011 Jul 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21561863
17.
Analyzing complicated protein folding kinetics rapidly by analytical Laplace inversion using a Tikhonov regularization variant.
Anal Biochem
; 421(1): 181-90, 2012 Feb 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22119751
18.
Current directions in combining simulation-based macromolecular modeling approaches with deep learning.
Expert Opin Drug Discov
; 16(9): 1025-1044, 2021 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33993816
19.
Anchor extension: a structure-guided approach to design cyclic peptides targeting enzyme active sites.
Nat Commun
; 12(1): 3384, 2021 06 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34099674
20.
Ensuring scientific reproducibility in bio-macromolecular modeling via extensive, automated benchmarks.
Nat Commun
; 12(1): 6947, 2021 11 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34845212