Detalhe da pesquisa
1.
Inferring cancer progression from Single-Cell Sequencing while allowing mutation losses.
Bioinformatics
; 37(3): 326-333, 2021 04 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32805010
2.
gpps: an ILP-based approach for inferring cancer progression with mutation losses from single cell data.
BMC Bioinformatics
; 21(Suppl 1): 413, 2020 Dec 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33297943
3.
HapCHAT: adaptive haplotype assembly for efficiently leveraging high coverage in long reads.
BMC Bioinformatics
; 19(1): 252, 2018 07 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29970002
4.
PWHATSHAP: efficient haplotyping for future generation sequencing.
BMC Bioinformatics
; 17(Suppl 11): 342, 2016 Sep 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28185544
5.
From PDB files to protein features: a comparative analysis of PDB bind and STCRDAB datasets.
Med Biol Eng Comput
; 2024 Apr 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38622438
6.
PseAAC2Vec protein encoding for TCR protein sequence classification.
Comput Biol Med
; 170: 107956, 2024 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38217977
7.
Lateral gene transfer, rearrangement, reconciliation.
BMC Bioinformatics
; 14 Suppl 15: S4, 2013.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24564205
8.
Mapping proteins in the presence of paralogs using units of coevolution.
BMC Bioinformatics
; 14 Suppl 15: S18, 2013.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24564758
9.
Exploring the Potential of GANs in Biological Sequence Analysis.
Biology (Basel)
; 12(6)2023 Jun 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37372139
10.
When Protein Structure Embedding Meets Large Language Models.
Genes (Basel)
; 15(1)2023 12 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38254915
11.
Characterizing SARS-CoV-2 Spike Sequences Based on Geographical Location.
J Comput Biol
; 30(4): 432-445, 2023 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36656554
12.
Reads2Vec: Efficient Embedding of Raw High-Throughput Sequencing Reads Data.
J Comput Biol
; 30(4): 469-491, 2023 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36730750
13.
ViralVectors: compact and scalable alignment-free virome feature generation.
Med Biol Eng Comput
; 61(10): 2607-2626, 2023 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37395885
14.
Assessing the Resilience of Machine Learning Classification Algorithms on SARS-CoV-2 Genome Sequences Generated with Long-Read Specific Errors.
Biomolecules
; 13(6)2023 06 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37371514
15.
Benchmarking machine learning robustness in Covid-19 genome sequence classification.
Sci Rep
; 13(1): 4154, 2023 03 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36914815
16.
Linearization of ancestral multichromosomal genomes.
BMC Bioinformatics
; 13 Suppl 19: S11, 2012.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23281593
17.
Efficient analysis of COVID-19 clinical data using machine learning models.
Med Biol Eng Comput
; 60(7): 1881-1896, 2022 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35507111
18.
Determining Significant Correlation Between Pairs of Extant Characters in a Small Parsimony Framework.
J Comput Biol
; 29(10): 1132-1154, 2022 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35723627
19.
PWM2Vec: An Efficient Embedding Approach for Viral Host Specification from Coronavirus Spike Sequences.
Biology (Basel)
; 11(3)2022 Mar 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35336792
20.
Efficient Approximate Kernel Based Spike Sequence Classification.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; PP2022 Sep 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36103437