Detalhe da pesquisa
1.
ZEPPI: Proteome-scale sequence-based evaluation of protein-protein interaction models.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 121(21): e2400260121, 2024 May 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38743624
2.
Integrating 3D structural information into systems biology.
J Biol Chem
; 296: 100562, 2021.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33744294
3.
Bi-allelic missense disease-causing variants in RPL3L associate neonatal dilated cardiomyopathy with muscle-specific ribosome biogenesis.
Hum Genet
; 139(11): 1443-1454, 2020 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32514796
4.
Genetic Drivers of Kidney Defects in the DiGeorge Syndrome.
N Engl J Med
; 376(8): 742-754, 2017 02 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28121514
5.
Structure-based prediction of ligand-protein interactions on a genome-wide scale.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 114(52): 13685-13690, 2017 12 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29229851
6.
Structure-based prediction of protein-protein interactions on a genome-wide scale.
Nature
; 490(7421): 556-60, 2012 Oct 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23023127
7.
De novo missense variants in PPP2R5D are associated with intellectual disability, macrocephaly, hypotonia, and autism.
Neurogenetics
; 17(1): 43-9, 2016 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26576547
8.
Predicting peptide-mediated interactions on a genome-wide scale.
PLoS Comput Biol
; 11(5): e1004248, 2015 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25938916
9.
PrePPI: a structure-informed database of protein-protein interactions.
Nucleic Acids Res
; 41(Database issue): D828-33, 2013 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23193263
10.
PredUs: a web server for predicting protein interfaces using structural neighbors.
Nucleic Acids Res
; 39(Web Server issue): W283-7, 2011 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21609948
11.
MarkUs: a server to navigate sequence-structure-function space.
Nucleic Acids Res
; 39(Web Server issue): W357-61, 2011 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21672961
12.
Protein interface conservation across structure space.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 107(24): 10896-901, 2010 Jun 15.
Artigo
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| MEDLINE | ID: mdl-20534496
13.
ZEPPI: proteome-scale sequence-based evaluation of protein-protein interaction models.
Res Sq
; 2023 Sep 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37790387
14.
PrePPI: A structure informed proteome-wide database of protein-protein interactions.
bioRxiv
; 2023 02 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36909476
15.
PrePPI: A Structure Informed Proteome-wide Database of Protein-Protein Interactions.
J Mol Biol
; 435(14): 168052, 2023 07 15.
Artigo
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| MEDLINE | ID: mdl-36933822
16.
PrePCI: A structure- and chemical similarity-informed database of predicted protein compound interactions.
Protein Sci
; 32(4): e4594, 2023 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36776141
17.
Solution NMR structure of Alr2454 from Nostoc sp. PCC 7120, the first structural representative of Pfam domain family PF11267.
J Struct Funct Genomics
; 13(3): 171-6, 2012 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22592539
18.
Solution NMR structures reveal unique homodimer formation by a winged helix-turn-helix motif and provide first structures for protein domain family PF10771.
J Struct Funct Genomics
; 13(1): 1-7, 2012 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22223187
19.
Using structure to explore the sequence alignment space of remote homologs.
PLoS Comput Biol
; 7(10): e1002175, 2011 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21998567
20.
PUDGE: a flexible, interactive server for protein structure prediction.
Nucleic Acids Res
; 38(Web Server issue): W550-4, 2010 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20525783