Detalhe da pesquisa
1.
Substrate Affinity Versus Catalytic Efficiency: Ancestral Sequence Reconstruction of tRNA Nucleotidyltransferases Solves an Enzyme Puzzle.
Mol Biol Evol
; 39(12)2022 12 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36409584
2.
Evolution of DNA Methylation Across Ecdysozoa.
J Mol Evol
; 90(1): 56-72, 2022 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35089376
3.
Divergent Evolution of Eukaryotic CC- and A-Adding Enzymes.
Int J Mol Sci
; 21(2)2020 Jan 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31936900
4.
Unusual Occurrence of Two Bona-Fide CCA-Adding Enzymes in Dictyostelium discoideum.
Int J Mol Sci
; 21(15)2020 Jul 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32717856
5.
Toward a mechanistic explanation of phenotypic evolution: The need for a theory of theory integration.
J Exp Zool B Mol Dev Evol
; 330(1): 5-14, 2018 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29356321
6.
Expansion of gene clusters, circular orders, and the shortest Hamiltonian path problem.
J Math Biol
; 77(2): 313-341, 2018 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29260295
7.
Uncovering missing pieces: duplication and deletion history of arrestins in deuterostomes.
BMC Evol Biol
; 17(1): 163, 2017 07 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28683816
8.
Ecological plant epigenetics: Evidence from model and non-model species, and the way forward.
Ecol Lett
; 20(12): 1576-1590, 2017 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29027325
9.
The ancestor of modern Holozoa acquired the CCA-adding enzyme from Alphaproteobacteria by horizontal gene transfer.
Nucleic Acids Res
; 43(14): 6739-46, 2015 Aug 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26117543
10.
The CHR site: definition and genome-wide identification of a cell cycle transcriptional element.
Nucleic Acids Res
; 42(16): 10331-50, 2014.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25106871
11.
Algebraic Dynamic Programming over general data structures.
BMC Bioinformatics
; 16 Suppl 19: S2, 2015.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26695390
12.
Transcriptional regulation by histone modifications: towards a theory of chromatin re-organization during stem cell differentiation.
Phys Biol
; 10(2): 026006, 2013 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23481318
13.
Chromatin computation: epigenetic inheritance as a pattern reconstruction problem.
J Theor Biol
; 336: 61-74, 2013 Nov 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23880640
14.
Complete HOX cluster characterization of the coelacanth provides further evidence for slow evolution of its genome.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 107(8): 3622-7, 2010 Feb 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20139301
15.
Proteinortho: detection of (co-)orthologs in large-scale analysis.
BMC Bioinformatics
; 12: 124, 2011 Apr 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21526987
16.
Hox clusters of the bichir (Actinopterygii, Polypterus senegalus) highlight unique patterns of sequence evolution in gnathostome phylogeny.
J Exp Zool B Mol Dev Evol
; 316(6): 451-64, 2011 Sep 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21688387
17.
The challenges and scope of theoretical biology.
J Theor Biol
; 276(1): 269-76, 2011 May 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21315730
18.
"Hypothesis for the modern RNA world": a pervasive non-coding RNA-based genetic regulation is a prerequisite for the emergence of multicellular complexity.
Orig Life Evol Biosph
; 41(6): 587-607, 2011 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22322874
19.
Genomic organization of eukaryotic tRNAs.
BMC Genomics
; 11: 270, 2010 Apr 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20426822
20.
Evolution of vault RNAs.
Mol Biol Evol
; 26(9): 1975-91, 2009 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19491402