Detalhe da pesquisa
1.
Mega-scale experimental analysis of protein folding stability in biology and design.
Nature
; 620(7973): 434-444, 2023 Aug.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37468638
2.
In vivo selection of synthetic nucleocapsids for tissue targeting.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 120(46): e2306129120, 2023 Nov 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37939083
3.
Dissecting the stability determinants of a challenging de novo protein fold using massively parallel design and experimentation.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 119(41): e2122676119, 2022 10 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36191185
4.
Computational design of a synthetic PD-1 agonist.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 118(29)2021 07 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34272285
5.
Massively parallel de novo protein design for targeted therapeutics.
Nature
; 550(7674): 74-79, 2017 10 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28953867
6.
Accurate de novo design of hyperstable constrained peptides.
Nature
; 538(7625): 329-335, 2016 Oct 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27626386
7.
Separated topologies--a method for relative binding free energy calculations using orientational restraints.
J Chem Phys
; 138(8): 085104, 2013 Feb 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23464180
8.
Calculating the binding free energies of charged species based on explicit-solvent simulations employing lattice-sum methods: an accurate correction scheme for electrostatic finite-size effects.
J Chem Phys
; 139(18): 184103, 2013 Nov 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24320250
9.
Docking for fragment inhibitors of AmpC beta-lactamase.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 106(18): 7455-60, 2009 May 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19416920
10.
Prediction and Validation of a Protein's Free Energy Surface Using Hydrogen Exchange and (Importantly) Its Denaturant Dependence.
J Chem Theory Comput
; 18(1): 550-561, 2022 Jan 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34936354
11.
Large-scale design and refinement of stable proteins using sequence-only models.
PLoS One
; 17(3): e0265020, 2022.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35286324
12.
The influence of proline isomerization on potency and stability of anti-HIV antibody 10E8.
Sci Rep
; 10(1): 14313, 2020 08 31.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32868832
13.
Global analysis of protein folding using massively parallel design, synthesis, and testing.
Science
; 357(6347): 168-175, 2017 07 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28706065
14.
Calculating the sensitivity and robustness of binding free energy calculations to force field parameters.
J Chem Theory Comput
; 9(7): 3072-3083, 2013 Jul 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24015114
15.
Blind prediction of charged ligand binding affinities in a model binding site.
J Mol Biol
; 425(22): 4569-83, 2013 Nov 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23896298
16.
Predicting ligand binding affinity with alchemical free energy methods in a polar model binding site.
J Mol Biol
; 394(4): 747-63, 2009 Dec 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19782087