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1.
Mol Cell ; 72(5): 902-915.e7, 2018 12 06.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-30392928

RESUMO

Chromatin adopts a diversity of regular and irregular fiber structures in vitro and in vivo. However, how an array of nucleosomes folds into and switches between different fiber conformations is poorly understood. We report the 9.7 Å resolution crystal structure of a 6-nucleosome array bound to linker histone H1 determined under ionic conditions that favor incomplete chromatin condensation. The structure reveals a flat two-start helix with uniform nucleosomal stacking interfaces and a nucleosome packing density that is only half that of a twisted 30-nm fiber. Hydroxyl radical footprinting indicates that H1 binds the array in an on-dyad configuration resembling that observed for mononucleosomes. Biophysical, cryo-EM, and crosslinking data validate the crystal structure and reveal that a minor change in ionic environment shifts the conformational landscape to a more compact, twisted form. These findings provide insights into the structural plasticity of chromatin and suggest a possible assembly pathway for a 30-nm fiber.


Assuntos
DNA/química , Histonas/química , Proteína 1 de Modelagem do Nucleossomo/química , Nucleossomos/ultraestrutura , Animais , Sítios de Ligação , Clonagem Molecular , Microscopia Crioeletrônica , Cristalografia por Raios X , DNA/genética , DNA/metabolismo , Escherichia coli/genética , Escherichia coli/metabolismo , Expressão Gênica , Vetores Genéticos/química , Vetores Genéticos/metabolismo , Histonas/genética , Histonas/metabolismo , Humanos , Radical Hidroxila/química , Modelos Moleculares , Proteína 1 de Modelagem do Nucleossomo/genética , Proteína 1 de Modelagem do Nucleossomo/metabolismo , Nucleossomos/química , Nucleossomos/metabolismo , Concentração Osmolar , Ligação Proteica , Conformação Proteica em alfa-Hélice , Conformação Proteica em Folha beta , Domínios e Motivos de Interação entre Proteínas , Multimerização Proteica , Proteínas Recombinantes/química , Proteínas Recombinantes/genética , Proteínas Recombinantes/metabolismo , Xenopus laevis
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