Pesquisa | BVS IEC

1.

Modeling the zinc effect on OsASR5-STAR1 promoter interaction by molecular dynamics.

Barros, Nicolle Louise Ferreira; Siqueira, Andrei Santos; Arenhart, Rafael Augusto; Margis-Pinheiro, Marcia.

Proteins ; 91(7): 944-955, 2023 07.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36840694

2.

Genomic screening and molecular dynamics simulations of cyanovirin-N homologs from cyanobacteria phylum.

Siqueira, Andrei Santos; Lima, Alex Ranieri Jerônimo; Aguiar, Delia Cristina Figueira; Santos, Alberdan Silva; Gonçalves, Evonnildo Costa.

Proteins ; 89(3): 322-329, 2021 03.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33067809

3.

A new Piper nigrum cysteine proteinase inhibitor, PnCPI, with antifungal activity: molecular cloning, recombinant expression, functional analyses and molecular modeling.

Lima, Aline Medeiros; Barros, Nicolle Louise Ferreira; Freitas, Ana Camila Oliveira; Tavares, Liliane Souza Conceição; Pirovani, Carlos Priminho; Siqueira, Andrei Santos; Gonçalves, Evonnildo Costa; de Souza, Cláudia Regina Batista.

Planta ; 252(2): 16, 2020 Jul 13.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-32661769

4.

Genomic screening of new putative antiviral lectins from Amazonian cyanobacteria based on a bioinformatics approach.

Siqueira, Andrei Santos; Lima, Alex Ranieri Jerônimo; Aguiar, Delia Cristina Figueira; Santos, Alberdan Silva; Vianez Júnior, João Lídio da Silva Gonçalves; Gonçalves, Evonnildo Costa.

Proteins ; 86(10): 1047-1054, 2018 10.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-30035823

5.

Anti-dengue virus activity of scytovirin and evaluation of point mutation effects by molecular dynamics and binding free energy calculations.

Siqueira, Andrei Santos; Jerônimo Lima, Alex Ranieri; de Souza, Rafael Conceição; Santos, Alberdan Silva; da Silva Gonçalves Vianez Júnior, João Lídio; Gonçalves, Evonnildo Costa.

Biochem Biophys Res Commun ; 490(3): 1033-1038, 2017 08 26.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-28666874

6.

In silico analysis of the cyanobacterial lectin scytovirin: new insights into binding properties.

Siqueira, Andrei Santos; Lima, Alex Ranieri Jerônimo; de Souza, Rafael Conceição; Santos, Alberdan Silva; Vianez Júnior, João Lídio da Silva Gonçalves; Gonçalves, Evonnildo Costa.

Mol Biol Rep ; 44(4): 353-358, 2017 Aug.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-28756560

7.

In Silico Analysis of a GH3 ß-Glucosidase from Microcystis aeruginosa CACIAM 03.

Serra, Gustavo Marques; Siqueira, Andrei Santos; de Molfetta, Fábio Alberto; Santos, Agenor Valadares; Xavier, Luciana Pereira.

Microorganisms ; 11(4)2023 Apr 11.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37110421

8.

First molecular detection of canine herpesvirus 1 (CaHV-1) in the Eastern Brazilian Amazon.

Castro, Marcela Dos Santos; David, Maridelzira Betania Moraes; Gonçalves, Evonnildo Costa; Siqueira, Andrei Santos; Virgulino, Rodrigo Rodrigues; Aguiar, Delia Cristina Figueira.

J Vet Sci ; 23(2): e18, 2022 Mar.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35187876

9.

Virtual screening and repurposing of approved drugs targeting homoserine dehydrogenase from Paracoccidioides brasiliensis.

da Cruz, Eliete Costa; Silva, Marcos Jessé Abrahão; Gama, Geovanna Carla Bandeira; Pinheiro, Andrey Henrique Gama; Gonçalves, Evonnildo Costa; Siqueira, Andrei Santos.

J Mol Model ; 28(11): 374, 2022 Nov 03.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36323986

10.

In silico improvement of the cyanobacterial lectin microvirin and mannose interaction.

Lima, Adonis de Melo; Siqueira, Andrei Santos; Möller, Marina Luiza Saraiva; Souza, Rafael Conceição de; Cruz, Jorddy Neves; Lima, Alex Ranieri Jerônimo; Silva, Ronaldo Correia da; Aguiar, Délia Cristina Figueira; Junior, João Lídio da Silva Gonçalves Vianez; Gonçalves, Evonnildo Costa.

J Biomol Struct Dyn ; 40(3): 1064-1073, 2022 02.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-32990187

11.

Anabaenopeptins: What We Know So Far.

Monteiro, Patrick Romano; do Amaral, Samuel Cavalcante; Siqueira, Andrei Santos; Xavier, Luciana Pereira; Santos, Agenor Valadares.

Toxins (Basel) ; 13(8)2021 07 27.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34437393

12.

In silico characterization of a cyanobacterial plant-type isoaspartyl aminopeptidase/asparaginase.

da Silva, Ronaldo Correia; Siqueira, Andrei Santos; Lima, Alex Ranieri Jerônimo; de Melo Lima, Adonis; Santos, Alberdan Silva; Aguiar, Délia Cristina Figueira; Gonçalves, Evonnildo Costa.

J Mol Model ; 24(5): 108, 2018 Apr 04.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-29619654

13.

Insights Into Limnothrix sp. Metabolism Based on Comparative Genomics.

Lima, Alex Ranieri Jerônimo; Siqueira, Andrei Santos; de Vasconcelos, Janaina Mota; Pereira, James Siqueira; de Azevedo, Juliana Simão Nina; Moraes, Pablo Henrique Gonçalves; Aguiar, Délia Cristina Figueira; de Lima, Clayton Pereira Silva; Vianez-Júnior, João Lídio Silva Gonçalves; Nunes, Márcio Roberto Teixeira; Xavier, Luciana Pereira; Dall'Agnol, Leonardo Teixeira; Goncalves, Evonnildo Costa.

Front Microbiol ; 9: 2811, 2018.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-30515147

14.

The relationship between IL-4 polymorphisms and asthma: a systematic review / A relação entre polimorfismos de IL-4 e asma: uma revisão sistemática

Silva, Marcos Jessé Abrahão; Monteiro, Ellerson Oliveira Loureiro; Silva, Bianca Benicio e; Martins, Debora Zoila da Conceição; Siqueira, Andrei Santos; Santana, Bárbara Brasil.

Rev. Inst. Adolfo Lutz ; 81: e37177, mar.1, 2022. tab

Artigo em Inglês | LILACS, CONASS, Coleciona SUS (Brasil), SES-SP, VETINDEX, SESSP-ACVSES, SESSP-IALPROD, SES-SP, SESSP-IALACERVO | ID: biblio-1395715

15.

Virtual screening and repurposing of approved drugs targeting homoserine dehydrogenase from Paracoccidioides brasiliensis

Cruz, Eliete Costa da; Silva, Marcos Jessé Abrahão; Gama, Geovanna Carla Bandeira; Pinheiro, Andrey Henrique Gama; Gonçalves, Evonnildo Costa; Siqueira, Andrei Santos.

CRUZ, Eliete Costa da et al. Virtual screening and repurposing of approved drugs targeting homoserine dehydrogenase from Paracoccidioides brasiliensis. Journal of Molecular Modeling, v. 28, n. 11, Nov. 2022. DOI: https://doi.org/10.1007/s00894-022-05335-0.

Artigo em Inglês | Instituto Evandro Chagas (DSpace) | ID: ied-6671

16.

Draft Genome Sequence of Alkalinema sp. Strain CACIAM 70d, a Cyanobacterium Isolated from an Amazonian Freshwater Environment.

Lima, Alex Ranieri Jerônimo; Castro, Wendel de Oliveira; Moraes, Pablo Henrique Gonçalves; Siqueira, Andrei Santos; Aguiar, Délia Cristina Figueira; de Lima, Clayton Pereira Silva; Vianez-Júnior, João Lídio Silva Gonçalves; Nunes, Márcio Roberto Teixeira; Dall'Agnol, Leonardo Teixeira; Gonçalves, Evonnildo Costa.

Genome Announc ; 5(28)2017 Jul 13.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-28705982

17.

In silico improvement of the cyanobacterial lectin microvirin and mannose interaction

Lima, Adonis de Melo; Siqueira, Andrei Santos; Moller, Marina Luiza Saraiva; Souza, Rafael Conceição de; Cruz, Joddy Neves; Lima, Alex Ranieri Jerônimo; Silva, Ronaldo Correia da; Aguiar, Délia Cristina Figueira; Vianez Júnior, João Lídio da Silva Gonçalves; Gonçalves, Evonnildo Costa.

LIMA, Adonis de Melo et al. In silico improvement of the cyanobacterial lectin microvirin and mannose interaction. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, v. 40, n. 3, p. 1064-1073, Sept. 2022. DOI: https://doi.org/10.1080/07391102.2020.1821782.

Artigo em Inglês | Instituto Evandro Chagas (DSpace) | ID: ied-4178

18.

Complete Genome Sequence of Porphyrobacter sp. Strain CACIAM 03H1, a Proteobacterium Obtained from a Nonaxenic Culture of Microcystis aeruginosa.

Castro, Wendel de Oliveira; Lima, Alex Ranieri Jerônimo; Moraes, Pablo Henrique Gonçalves; Siqueira, Andrei Santos; Aguiar, Délia Cristina Figueira; Baraúna, Anna Rafaella Ferreira; Martins, Luisa Carício; Fuzii, Hellen Thais; Couto, Danielle Costa Carrara; Francês, Regiane Silva Kawasaki; Silva de Lima, Clayton Pereira; Vianez-Júnior, João Lídio Silva Gonçalves; Nunes, Márcio Roberto Teixeira; Dall'Agnol, Leonardo Teixeira; Gonçalves, Evonnildo Costa.

Genome Announc ; 5(41)2017 Oct 12.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-29025942

19.

Comparative modeling and molecular dynamics suggest high carboxylase activity of the Cyanobium sp. CACIAM14 RbcL protein.

Siqueira, Andrei Santos; Lima, Alex Ranieri Jerônimo; Dall'Agnol, Leonardo Teixeira; de Azevedo, Juliana Simão Nina; da Silva Gonçalves Vianez, João Lídio; Gonçalves, Evonnildo Costa.

J Mol Model ; 22(3): 68, 2016 Mar.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-26936271

20.

Investigating the effects of point mutations on the affinity between the cyanobacterial lectin microvirin and high mannose-type glycans present on the HIV envelope glycoprotein.

Conceição de Souza, Rafael; de Medeiros Muniz, Gabriela; Siqueira, Andrei Santos; de Melo Lima, Adonis; da Silva, Alessandra Pereira; Gonçalves, Evonnildo Costa; da Silva Gonçalves Vianez Júnior, João Lídio.

J Mol Model ; 22(11): 269, 2016 Nov.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-27771810

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