Detalhe da pesquisa
1.
GC content, but not nucleosome positioning, directly contributes to intron splicing efficiency in Paramecium.
Genome Res
; 32(4): 699-709, 2022 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35264448
2.
Inter-generational nuclear crosstalk links the control of gene expression to programmed genome rearrangement during the Paramecium sexual cycle.
Nucleic Acids Res
; 51(22): 12337-12351, 2023 Dec 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37953377
3.
Dynamics of Gene Loss following Ancient Whole-Genome Duplication in the Cryptic Paramecium Complex.
Mol Biol Evol
; 40(5)2023 05 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37154524
4.
Massive colonization of protein-coding exons by selfish genetic elements in Paramecium germline genomes.
PLoS Biol
; 19(7): e3001309, 2021 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34324490
5.
ParameciumDB 2019: integrating genomic data across the genus for functional and evolutionary biology.
Nucleic Acids Res
; 48(D1): D599-D605, 2020 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31733062
6.
Genome-defence small RNAs exapted for epigenetic mating-type inheritance.
Nature
; 509(7501): 447-52, 2014 May 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24805235
7.
A mating-type mutagenesis screen identifies a zinc-finger protein required for specific DNA excision events in Paramecium.
Nucleic Acids Res
; 46(18): 9550-9562, 2018 10 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30165457
8.
A meiosis-specific Spt5 homolog involved in non-coding transcription.
Nucleic Acids Res
; 45(8): 4722-4732, 2017 05 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28053118
9.
Flow cytometry sorting of nuclei enables the first global characterization of Paramecium germline DNA and transposable elements.
BMC Genomics
; 18(1): 327, 2017 04 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28446146
10.
Improved methods and resources for paramecium genomics: transcription units, gene annotation and gene expression.
BMC Genomics
; 18(1): 483, 2017 06 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28651633
11.
ParTIES: a toolbox for Paramecium interspersed DNA elimination studies.
Bioinformatics
; 32(4): 599-601, 2016 Feb 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26589276
12.
Local effect of enhancer of zeste-like reveals cooperation of epigenetic and cis-acting determinants for zygotic genome rearrangements.
PLoS Genet
; 10(9): e1004665, 2014 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25254958
13.
Genome-wide analysis of genetic and epigenetic control of programmed DNA deletion.
Nucleic Acids Res
; 42(14): 8970-83, 2014 Aug.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25016527
14.
The Paramecium germline genome provides a niche for intragenic parasitic DNA: evolutionary dynamics of internal eliminated sequences.
PLoS Genet
; 8(10): e1002984, 2012.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23071448
15.
Translational control of intron splicing in eukaryotes.
Nature
; 451(7176): 359-62, 2008 Jan 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18202663
16.
ParameciumDB in 2011: new tools and new data for functional and comparative genomics of the model ciliate Paramecium tetraurelia.
Nucleic Acids Res
; 39(Database issue): D632-6, 2011 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20952411
17.
Global trends of whole-genome duplications revealed by the ciliate Paramecium tetraurelia.
Nature
; 444(7116): 171-8, 2006 Nov 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-17086204
18.
Functional study of genes essential for autogamy and nuclear reorganization in Paramecium.
Eukaryot Cell
; 10(3): 363-72, 2011 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21257794
19.
Evolutionary Plasticity of Mating-Type Determination Mechanisms in Paramecium aurelia Sibling Species.
Genome Biol Evol
; 13(2)2021 02 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33313646
20.
Gene expression in a paleopolyploid: a transcriptome resource for the ciliate Paramecium tetraurelia.
BMC Genomics
; 11: 547, 2010 Oct 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20932287