Detalhe da pesquisa
1.
Sequencing identifies multiple early introductions of SARS-CoV-2 to the New York City region.
Genome Res
; 30(12): 1781-1788, 2020 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33093069
2.
Additive Uncorrelated Relaxed Clock Models for the Dating of Genomic Epidemiology Phylogenies.
Mol Biol Evol
; 38(1): 307-317, 2021 01 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32722797
3.
Non-pharmaceutical interventions, vaccination, and the SARS-CoV-2 delta variant in England: a mathematical modelling study.
Lancet
; 398(10313): 1825-1835, 2021 11 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34717829
4.
Identification of Hidden Population Structure in Time-Scaled Phylogenies.
Syst Biol
; 69(5): 884-896, 2020 09 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32049340
5.
Modeling the Growth and Decline of Pathogen Effective Population Size Provides Insight into Epidemic Dynamics and Drivers of Antimicrobial Resistance.
Syst Biol
; 67(4): 719-728, 2018 07 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29432602
6.
Bayesian phylodynamic inference with complex models.
PLoS Comput Biol
; 14(11): e1006546, 2018 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30422979
7.
Molecular Epidemiology of HIV-1 Subtype B Reveals Heterogeneous Transmission Risk: Implications for Intervention and Control.
J Infect Dis
; 217(10): 1522-1529, 2018 04 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29506269
8.
Phylodynamic Inference across Epidemic Scales.
Mol Biol Evol
; 34(5): 1276-1288, 2017 05 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28204593
9.
Host or pathogen-related factors in COVID-19 severity? - Authors' reply.
Lancet
; 396(10260): 1397, 2020 10 31.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33129392
10.
Phylodynamic inference for structured epidemiological models.
PLoS Comput Biol
; 10(4): e1003570, 2014 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24743590
11.
Viral phylodynamics.
PLoS Comput Biol
; 9(3): e1002947, 2013.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23555203
12.
Inferring the source of transmission with phylogenetic data.
PLoS Comput Biol
; 9(12): e1003397, 2013.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24367249
13.
Assessing transmission attribution risk from simulated sequencing data in HIV molecular epidemiology.
AIDS
; 38(6): 865-873, 2024 May 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38126363
14.
Phylogenomic early warning signals for SARS-CoV-2 epidemic waves.
EBioMedicine
; 100: 104939, 2024 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38194742
15.
HIV-1 transmission during early infection in men who have sex with men: a phylodynamic analysis.
PLoS Med
; 10(12): e1001568; discussion e1001568, 2013 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24339751
16.
Simple epidemiological dynamics explain phylogenetic clustering of HIV from patients with recent infection.
PLoS Comput Biol
; 8(6): e1002552, 2012.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22761556
17.
Model hierarchies in edge-based compartmental modeling for infectious disease spread.
J Math Biol
; 67(4): 869-99, 2013 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22911242
18.
Model design for nonparametric phylodynamic inference and applications to pathogen surveillance.
Virus Evol
; 9(1): vead028, 2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37229349
19.
Effects of heterogeneous and clustered contact patterns on infectious disease dynamics.
PLoS Comput Biol
; 7(6): e1002042, 2011 Jun.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21673864
20.
Model design for non-parametric phylodynamic inference and applications to pathogen surveillance.
bioRxiv
; 2021 Aug 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34426812