Detalhe da pesquisa
1.
Thermococcus argininiproducens sp. nov., an arginine biosynthesis archaeal species isolated from the Central Indian Ocean ridge.
Int J Syst Evol Microbiol
; 73(4)2023 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37022754
2.
Telomere-to-telomere genome assembly of asparaginase-producing Trichoderma simmonsii.
BMC Genomics
; 22(1): 830, 2021 Nov 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34789157
3.
GRASP2: fast and memory-efficient gene-centric assembly and homolog search for metagenomic sequencing data.
BMC Bioinformatics
; 20(Suppl 11): 276, 2019 Jun 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31167633
4.
Precision-guided antimicrobial peptide as a targeted modulator of human microbial ecology.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 112(24): 7569-74, 2015 Jun 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26034276
5.
Genomic and proteomic characterization of "Candidatus Nitrosopelagicus brevis": an ammonia-oxidizing archaeon from the open ocean.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 112(4): 1173-8, 2015 Jan 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25587132
6.
Metagenome and Metatranscriptome Analyses Using Protein Family Profiles.
PLoS Comput Biol
; 12(7): e1004991, 2016 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27400380
7.
GRASP: guided reference-based assembly of short peptides.
Nucleic Acids Res
; 43(3): e18, 2015 Feb 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25414351
8.
GRASPx: efficient homolog-search of short peptide metagenome database through simultaneous alignment and assembly.
BMC Bioinformatics
; 17 Suppl 8: 283, 2016 Aug 31.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27585568
9.
SFA-SPA: a suffix array based short peptide assembler for metagenomic data.
Bioinformatics
; 31(11): 1833-5, 2015 Jun 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25637561
10.
Candidate phylum TM6 genome recovered from a hospital sink biofilm provides genomic insights into this uncultivated phylum.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 110(26): E2390-9, 2013 Jun 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23754396
11.
SPA: a short peptide assembler for metagenomic data.
Nucleic Acids Res
; 41(8): e91, 2013 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23435317
12.
Integrated de novo gene prediction and peptide assembly of metagenomic sequencing data.
NAR Genom Bioinform
; 5(1): lqad023, 2023 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36915411
13.
A novel k-mer mixture logistic regression for methylation susceptibility modeling of CpG dinucleotides in human gene promoters.
BMC Bioinformatics
; 13 Suppl 3: S15, 2012 Mar 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22536899
14.
The complete mitochondrial genome of Trichoderma simmonsii (Hypocreales: Hypocreaceae) from the Southern Coast of Korea.
Mitochondrial DNA B Resour
; 7(4): 640-641, 2022.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35425856
15.
Complete gammaproteobacterial endosymbiont genome assembly from a seep tubeworm Lamellibrachia satsuma.
J Microbiol
; 60(9): 916-927, 2022 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35913594
16.
Chromosome-level genome assembly of the shuttles hoppfish, Periophthalmus modestus.
Gigascience
; 11(1)2022 01 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35022698
17.
Annotation confidence score for genome annotation: a genome comparison approach.
Bioinformatics
; 26(1): 22-9, 2010 Jan 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19855104
18.
Gene discovery in the horned beetle Onthophagus taurus.
BMC Genomics
; 11: 703, 2010 Dec 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21156066
19.
A garter snake transcriptome: pyrosequencing, de novo assembly, and sex-specific differences.
BMC Genomics
; 11: 694, 2010 Dec 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21138572
20.
First draft genome for the sand-hopper Trinorchestia longiramus.
Sci Data
; 7(1): 85, 2020 03 09.
Artigo
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| MEDLINE | ID: mdl-32152293