Phylogenetic analysis of population-based and deep sequencing data to identify coevolving sites in the nef gene of HIV-1.

Poon, Art F Y; Swenson, Luke C; Dong, Winnie W Y; Deng, Wenjie; Kosakovsky Pond, Sergei L; Brumme, Zabrina L; Mullins, James I; Richman, Douglas D; Harrigan, P Richard; Frost, Simon D W

Poon, Art F Y; Swenson, Luke C; Dong, Winnie W Y; Deng, Wenjie; Kosakovsky Pond, Sergei L; Brumme, Zabrina L; Mullins, James I; Richman, Douglas D; Harrigan, P Richard; Frost, Simon D W.

Afiliação

Poon AF; British Columbia Centre for Excellence in HIV/AIDS, Vancouver, British Columbia, Canada. apoon@cfenet.ubc.ca

Mol Biol Evol ; 27(4): 819-32, 2010 Apr.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-19955476

Assuntos

Evolução Molecular; Infecções por HIV/virologia; HIV-1/genética; Análise de Sequência de RNA/métodos; Produtos do Gene nef do Vírus da Imunodeficiência Humana/genética; Sequência de Aminoácidos; Colúmbia Britânica; Estudos de Coortes; Humanos; Dados de Sequência Molecular; Filogenia; Alinhamento de Sequência; Produtos do Gene nef do Vírus da Imunodeficiência Humana/química

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Infecções por HIV / HIV-1 / Análise de Sequência de RNA / Evolução Molecular / Produtos do Gene nef do Vírus da Imunodeficiência Humana Tipo de estudo: Etiology_studies / Incidence_studies / Observational_studies / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Humans País/Região como assunto: America do norte Idioma: En Revista: Mol Biol Evol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR Ano de publicação: 2010 Tipo de documento: Article País de afiliação: Canadá

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