Combined small RNA and degradome sequencing reveals microRNA regulation during immature maize embryo dedifferentiation.

Shen, Yaou; Jiang, Zhou; Lu, Sifen; Lin, Haijian; Gao, Shibin; Peng, Huanwei; Yuan, Guangsheng; Liu, Li; Zhang, Zhiming; Zhao, Maojun; Rong, Tingzhao; Pan, Guangtang

Shen, Yaou; Jiang, Zhou; Lu, Sifen; Lin, Haijian; Gao, Shibin; Peng, Huanwei; Yuan, Guangsheng; Liu, Li; Zhang, Zhiming; Zhao, Maojun; Rong, Tingzhao; Pan, Guangtang.

Afiliação

Shen Y; Maize Research Institute, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China. Electronic address: shenyaou@gmail.com.

Biochem Biophys Res Commun ; 441(2): 425-30, 2013 Nov 15.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-24183719

Assuntos

Desdiferenciação Celular/genética; Regulação da Expressão Gênica de Plantas; MicroRNAs/metabolismo; Estabilidade de RNA; RNA de Plantas/metabolismo; Sementes/crescimento & desenvolvimento; Zea mays/embriologia; Fatores de Transcrição Hélice-Alça-Hélice Básicos/genética; Fatores de Transcrição Hélice-Alça-Hélice Básicos/metabolismo; Sequências Hélice-Alça-Hélice; MicroRNAs/química; MicroRNAs/genética; RNA de Plantas/química; RNA de Plantas/genética; Sementes/genética; Sementes/metabolismo; Análise de Sequência de RNA; Zea mays/genética; Zea mays/metabolismo

Palavras-chave

ARF; CK; DEM; Dedifferentiation; Degradome sequencing; Dicer; GA; HLH; Immature embryo; MFE; Maize; NAM; QTL; RPM; Small RNA sequencing; auxin response factor; differentially expressed miRNA; double-stranded-specific RNase; gibberellin; helix-loop-helix; miRNA; miRNA regulation; microRNA; minimum free energy; no apical meristem; quantitative trait locus; reads per million clean reads; the control

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Sementes / RNA de Plantas / Regulação da Expressão Gênica de Plantas / Zea mays / Estabilidade de RNA / MicroRNAs / Desdiferenciação Celular Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Biochem Biophys Res Commun Ano de publicação: 2013 Tipo de documento: Article

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