iDNA-Methyl: identifying DNA methylation sites via pseudo trinucleotide composition.

Liu, Zi; Xiao, Xuan; Qiu, Wang-Ren; Chou, Kuo-Chen

Liu, Zi; Xiao, Xuan; Qiu, Wang-Ren; Chou, Kuo-Chen.

Afiliação

Liu Z; Computer Department, Jing-De-Zhen Ceramic Institute, Jing-De-Zhen 333403, China.
Xiao X; Computer Department, Jing-De-Zhen Ceramic Institute, Jing-De-Zhen 333403, China; Gordon Life Science Institute, Boston, MA 02478, USA. Electronic address: xxiao@gordonlifescience.org.
Qiu WR; Computer Department, Jing-De-Zhen Ceramic Institute, Jing-De-Zhen 333403, China. Electronic address: qiuone@163.com.
Chou KC; Gordon Life Science Institute, Boston, MA 02478, USA; Center of Excellence in Genomic Medicine Research (CEGMR), King Abdulaziz University, Jeddah 21589, Saudi Arabia.

Anal Biochem ; 474: 69-77, 2015 Apr 01.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-25596338

Assuntos

Biologia Computacional/métodos; Metilação de DNA/genética; Nucleotídeos/metabolismo; Software; Aminoácidos/metabolismo; Sequência de Bases; Códon/genética; Bases de Dados Genéticas; Humanos; Internet; Curva ROC; Reprodutibilidade dos Testes; Máquina de Vetores de Suporte

Palavras-chave

3â1 Codon conversion; DNA methylation; Neighborhood cleaning rule; Pseudo amino acid components; Synthetic minority oversampling technique; Targetjackknife cross-validation

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Software / Biologia Computacional / Metilação de DNA / Nucleotídeos Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: Anal Biochem Ano de publicação: 2015 Tipo de documento: Article País de afiliação: China

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