Binding cooperativity between a ligand carbonyl group and a hydrophobic side chain can be enhanced by additional H-bonds in a distance dependent manner: A case study with thrombin inhibitors.

Said, Ahmed M; Hangauer, David G

Said, Ahmed M; Hangauer, David G.

Afiliação

Said AM; Department of Chemistry, University at Buffalo, The State University of New York, Buffalo, NY 14260, USA. Electronic address: ahmedmoh@buffalo.edu.
Hangauer DG; Department of Chemistry, University at Buffalo, The State University of New York, Buffalo, NY 14260, USA. Electronic address: hangauer@buffalo.edu.

Eur J Med Chem ; 96: 405-24, 2015.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-25912673

Assuntos

Antitrombinas/farmacologia; Trombina/antagonistas & inibidores; Antitrombinas/química; Sítios de Ligação/efeitos dos fármacos; Relação Dose-Resposta a Droga; Ensaios de Seleção de Medicamentos Antitumorais; Humanos; Ligação de Hidrogênio; Interações Hidrofóbicas e Hidrofílicas; Ligantes; Modelos Moleculares; Estrutura Molecular; Relação Estrutura-Atividade; Trombina/metabolismo

Palavras-chave

B-factor; Cooperativity; Ligand binding affinity; Non-additivity; Protein-ligand binding; Scoring functions; Thrombin

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Trombina / Antitrombinas Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: Eur J Med Chem Ano de publicação: 2015 Tipo de documento: Article

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