Evaluation and assessment of read-mapping by multiple next-generation sequencing aligners based on genome-wide characteristics.

Thankaswamy-Kosalai, Subazini; Sen, Partho; Nookaew, Intawat

Thankaswamy-Kosalai, Subazini; Sen, Partho; Nookaew, Intawat.

Afiliação

Thankaswamy-Kosalai S; Department of Biology and Biological Engineering, Chalmers University of Technology, Kemivägen 10, SE-412 96 Göteborg, Sweden.
Sen P; Department of Biology and Biological Engineering, Chalmers University of Technology, Kemivägen 10, SE-412 96 Göteborg, Sweden.
Nookaew I; Department of Biology and Biological Engineering, Chalmers University of Technology, Kemivägen 10, SE-412 96 Göteborg, Sweden; Department of Biomedical Informatics, College of Medicine, University of Arkansas for Medical Sciences, Little Rock, AR 72205, USA. Electronic address: intawat@chalmers.se.

Genomics ; 109(3-4): 186-191, 2017 07.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28286147

Assuntos

Genoma; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Análise de Sequência de DNA/métodos; Software; Bactérias/genética; Eucariotos/genética; Sensibilidade e Especificidade; Alinhamento de Sequência; Sequências de Repetição em Tandem

Palavras-chave

Algorithm; Aligners; Alignments; Genome; Mapping; NGS; Next-generation sequencing; Reads

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Software / Genoma / Análise de Sequência de DNA / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Guideline Idioma: En Revista: Genomics Assunto da revista: GENETICA Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article País de afiliação: Suécia

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