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Transcriptome profiling of sorted endoreduplicated nuclei from tomato fruits: how the global shift in expression ascribed to DNA ploidy influences RNA-Seq data normalization and interpretation.
Pirrello, Julien; Deluche, Cynthia; Frangne, Nathalie; Gévaudant, Frédéric; Maza, Elie; Djari, Anis; Bourge, Mickaël; Renaudin, Jean-Pierre; Brown, Spencer; Bowler, Chris; Zouine, Mohamed; Chevalier, Christian; Gonzalez, Nathalie.
Afiliação
  • Pirrello J; UMR1332 BFP, INRA, Univ. Bordeaux, 33882, Villenave d'Ornon Cedex, France.
  • Deluche C; GBF, Université de Toulouse, INRA, 31326, Castanet-Tolosan Cedex, France.
  • Frangne N; UMR1332 BFP, INRA, Univ. Bordeaux, 33882, Villenave d'Ornon Cedex, France.
  • Gévaudant F; UMR1332 BFP, INRA, Univ. Bordeaux, 33882, Villenave d'Ornon Cedex, France.
  • Maza E; UMR1332 BFP, INRA, Univ. Bordeaux, 33882, Villenave d'Ornon Cedex, France.
  • Djari A; GBF, Université de Toulouse, INRA, 31326, Castanet-Tolosan Cedex, France.
  • Bourge M; GBF, Université de Toulouse, INRA, 31326, Castanet-Tolosan Cedex, France.
  • Renaudin JP; Institute of Integrative Biology of the Cell (I2BC), CEA, CNRS, Université Paris-Saclay, Université Paris-Saclay, 91198, Gif-sur-Yvette, France.
  • Brown S; UMR1332 BFP, INRA, Univ. Bordeaux, 33882, Villenave d'Ornon Cedex, France.
  • Bowler C; Institute of Integrative Biology of the Cell (I2BC), CEA, CNRS, Université Paris-Saclay, Université Paris-Saclay, 91198, Gif-sur-Yvette, France.
  • Zouine M; Département de Biologie, IBENS, Ecole Normale Supérieure, CNRS, Inserm, PSL Research University, F-75005, Paris, France.
  • Chevalier C; GBF, Université de Toulouse, INRA, 31326, Castanet-Tolosan Cedex, France.
  • Gonzalez N; UMR1332 BFP, INRA, Univ. Bordeaux, 33882, Villenave d'Ornon Cedex, France.
Plant J ; 93(2): 387-398, 2018 01.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-29172253
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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Solanum lycopersicum / Perfilação da Expressão Gênica / Endorreduplicação Idioma: En Revista: Plant J Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR / BOTANICA Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article País de afiliação: França
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