Application of whole genome data for in silico evaluation of primers and probes routinely employed for the detection of viral species by RT-qPCR using dengue virus as a case study.

Vanneste, Kevin; Garlant, Linda; Broeders, Sylvia; Van Gucht, Steven; Roosens, Nancy H

Vanneste, Kevin; Garlant, Linda; Broeders, Sylvia; Van Gucht, Steven; Roosens, Nancy H.

Afiliação

Vanneste K; Transversal activities in applied genomics, Sciensano, (1050), Brussels, Belgium. kevin.vanneste@sciensano.be.
Garlant L; Transversal activities in applied genomics, Sciensano, (1050), Brussels, Belgium.
Broeders S; Transversal activities in applied genomics, Sciensano, (1050), Brussels, Belgium.
Van Gucht S; Present address: Quality of Laboratories, Sciensano, (1050), Brussels, Belgium.
Roosens NH; Viral Diseases, Sciensano, (1050), Brussels, Belgium.

BMC Bioinformatics ; 19(1): 312, 2018 Sep 04.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-30180800

Assuntos

Simulação por Computador; Primers do DNA/análise; Vírus da Dengue/genética; Dengue/diagnóstico; Genoma Viral; RNA Viral/genética; Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real/métodos; Primers do DNA/genética; Dengue/virologia; Vírus da Dengue/classificação; Vírus da Dengue/isolamento & purificação; Humanos

Palavras-chave

BLAST; Dengue virus; RT-qPCR; Virus detection

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Simulação por Computador / RNA Viral / Genoma Viral / Primers do DNA / Dengue / Vírus da Dengue / Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Evaluation_studies / Prognostic_studies / Screening_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article País de afiliação: Bélgica

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