Predicting bacterial resistance from whole-genome sequences using k-mers and stability selection.

Mahé, Pierre; Tournoud, Maud

Mahé, Pierre; Tournoud, Maud.

Afiliação

Mahé P; bioMérieux, Chemin de l'Orme, Marcy l'Etoile, 69280, France. pierre.mahe@biomerieux.com.
Tournoud M; bioMérieux, Chemin de l'Orme, Marcy l'Etoile, 69280, France.

BMC Bioinformatics ; 19(1): 383, 2018 Oct 17.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-30332990

Assuntos

Algoritmos; Farmacorresistência Bacteriana/genética; Genoma Bacteriano; Mycobacterium tuberculosis/genética; Staphylococcus aureus/genética; Sequenciamento Completo do Genoma; Antibacterianos/farmacologia; Sequência de Bases; Bases de Dados Genéticas; Farmacorresistência Bacteriana/efeitos dos fármacos; Modelos Logísticos; Modelos Genéticos; Mycobacterium tuberculosis/efeitos dos fármacos; Curva ROC; Reprodutibilidade dos Testes; Staphylococcus aureus/efeitos dos fármacos

Palavras-chave

Feature selection; Genotype-phenotype; Lasso; k-mers

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Staphylococcus aureus / Algoritmos / Genoma Bacteriano / Farmacorresistência Bacteriana / Sequenciamento Completo do Genoma / Mycobacterium tuberculosis Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article País de afiliação: França

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