miRFA: an automated pipeline for microRNA functional analysis with correlation support from TCGA and TCPA expression data in pancreatic cancer.

Borgmästars, Emmy; de Weerd, Hendrik Arnold; Lubovac-Pilav, Zelmina; Sund, Malin

Borgmästars, Emmy; de Weerd, Hendrik Arnold; Lubovac-Pilav, Zelmina; Sund, Malin.

Afiliação

Borgmästars E; Department of Surgical and Perioperative Sciences, Umeå University, Umeå, Sweden. emmy.borgmastars@umu.se.
de Weerd HA; School of bioscience, Systems Biology Research Centre, University of Skövde, Skövde, Sweden.
Lubovac-Pilav Z; Department of Physics, Chemistry and Biology, Bioinformatics, Linköping University, Linköping, Sweden.
Sund M; School of bioscience, Systems Biology Research Centre, University of Skövde, Skövde, Sweden.

BMC Bioinformatics ; 20(1): 393, 2019 Jul 16.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31311505

Assuntos

MicroRNAs/metabolismo; Neoplasias Pancreáticas/genética; Proteínas/genética; Interface Usuário-Computador; Automação; Humanos; Estimativa de Kaplan-Meier; MicroRNAs/genética; Neoplasias Pancreáticas/mortalidade; Neoplasias Pancreáticas/patologia; Mapas de Interação de Proteínas; Proteínas/metabolismo; RNA Mensageiro/metabolismo

Palavras-chave

Functional enrichment; Mature miRNA; Pancreatic cancer; TCGA; TCPA; miRNA functional analysis; miRNA target prediction

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Neoplasias Pancreáticas / Interface Usuário-Computador / Proteínas / MicroRNAs Limite: Humans Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: Suécia

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