Long Non-Coding RNA Expression Levels Modulate Cell-Type-Specific Splicing Patterns by Altering Their Interaction Landscape with RNA-Binding Proteins.

Porto, Felipe Wendt; Daulatabad, Swapna Vidhur; Janga, Sarath Chandra

Porto, Felipe Wendt; Daulatabad, Swapna Vidhur; Janga, Sarath Chandra.

Afiliação

Porto FW; Department of BioHealth Informatics, School of Informatics and Computing, IUPUI, Indianapolis, IN 46202, USA.
Daulatabad SV; Department of BioHealth Informatics, School of Informatics and Computing, IUPUI, Indianapolis, IN 46202, USA.
Janga SC; Department of BioHealth Informatics, School of Informatics and Computing, IUPUI, Indianapolis, IN 46202, USA. scjanga@iupui.edu.

Genes (Basel) ; 10(8)2019 08 06.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31390792

Assuntos

Processamento Alternativo; Neoplasias/genética; RNA Longo não Codificante/genética; Proteínas de Ligação a RNA/metabolismo; Células HeLa; Humanos; Especificidade de Órgãos; Ligação Proteica; RNA Longo não Codificante/metabolismo; Proteínas de Ligação a RNA/genética

Palavras-chave

RNA-binding proteins; alternative splicing; cancer; cell-type-specific; functional enrichment; long non-coding RNA; protein binding lncRNA sponges; secondary RNA structure

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Proteínas de Ligação a RNA / Processamento Alternativo / RNA Longo não Codificante / Neoplasias Limite: Humans Idioma: En Revista: Genes (Basel) Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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