Rapid, multiplexed, whole genome and plasmid sequencing of foodborne pathogens using long-read nanopore technology.

Taylor, Tonya L; Volkening, Jeremy D; DeJesus, Eric; Simmons, Mustafa; Dimitrov, Kiril M; Tillman, Glenn E; Suarez, David L; Afonso, Claudio L

Taylor, Tonya L; Volkening, Jeremy D; DeJesus, Eric; Simmons, Mustafa; Dimitrov, Kiril M; Tillman, Glenn E; Suarez, David L; Afonso, Claudio L.

Afiliação

Taylor TL; Exotic and Emerging Avian Viral Diseases Research Unit, Southeast Poultry Research Laboratory, US National Poultry Research Center, Agricultural Research Service, USDA, 934 College Station Road, Athens, GA, USA.
Volkening JD; Office of Public Health Services, Food Safety and Inspection Services, USDA, 950 College Station Road, Athens, GA, USA.
DeJesus E; BASE2BIO, Oshkosh, WI, USA.
Simmons M; Office of Public Health Services, Food Safety and Inspection Services, USDA, 950 College Station Road, Athens, GA, USA.
Dimitrov KM; Office of Public Health Services, Food Safety and Inspection Services, USDA, 950 College Station Road, Athens, GA, USA.
Tillman GE; Exotic and Emerging Avian Viral Diseases Research Unit, Southeast Poultry Research Laboratory, US National Poultry Research Center, Agricultural Research Service, USDA, 934 College Station Road, Athens, GA, USA.
Suarez DL; Texas A&M Veterinary Medical Diagnostic Lab, Amarillo, Texas, USA.
Afonso CL; Office of Public Health Services, Food Safety and Inspection Services, USDA, 950 College Station Road, Athens, GA, USA.

Sci Rep ; 9(1): 16350, 2019 11 08.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31704961

Assuntos

Proteínas de Bactérias/genética; Escherichia coli/isolamento & purificação; Doenças Transmitidas por Alimentos/genética; Genoma Bacteriano; Plasmídeos/genética; Salmonella/isolamento & purificação; Sequenciamento Completo do Genoma/métodos; Animais; Escherichia coli/genética; Doenças Transmitidas por Alimentos/microbiologia; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Sequenciamento por Nanoporos/métodos; Salmonella/genética; Análise de Sequência de DNA/métodos; Fatores de Virulência/genética

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Plasmídeos / Salmonella / Proteínas de Bactérias / Genoma Bacteriano / Escherichia coli / Doenças Transmitidas por Alimentos / Sequenciamento Completo do Genoma Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Animals Idioma: En Revista: Sci Rep Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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