RNA-Seq Data-Mining Allows the Discovery of Two Long Non-Coding RNA Biomarkers of Viral Infection in Humans.

Barral-Arca, Ruth; Gómez-Carballa, Alberto; Cebey-López, Miriam; Currás-Tuala, María José; Pischedda, Sara; Viz-Lasheras, Sandra; Bello, Xabier; Martinón-Torres, Federico; Salas, Antonio

Barral-Arca, Ruth; Gómez-Carballa, Alberto; Cebey-López, Miriam; Currás-Tuala, María José; Pischedda, Sara; Viz-Lasheras, Sandra; Bello, Xabier; Martinón-Torres, Federico; Salas, Antonio.

Afiliação

Barral-Arca R; Unidade de Xenética, Instituto de Ciencias Forenses (INCIFOR), Facultade de Medicina, Universidade de Santiago de Compostela, 15782 Galicia, Spain.
Gómez-Carballa A; GenPoB Research Group, Instituto de Investigaciones Sanitarias (IDIS), Hospital Clínico Universitario de Santiago (SERGAS), 15706 Galicia, Spain.
Cebey-López M; Genetics, Vaccines and Pediatric Infectious Diseases Research Group (GENVIP), Instituto de Investigación Sanitaria de Santiago (IDIS) and Universidad de Santiago de Compostela (USC), 15706 Galicia, Spain.
Currás-Tuala MJ; Unidade de Xenética, Instituto de Ciencias Forenses (INCIFOR), Facultade de Medicina, Universidade de Santiago de Compostela, 15782 Galicia, Spain.
Pischedda S; GenPoB Research Group, Instituto de Investigaciones Sanitarias (IDIS), Hospital Clínico Universitario de Santiago (SERGAS), 15706 Galicia, Spain.
Viz-Lasheras S; Genetics, Vaccines and Pediatric Infectious Diseases Research Group (GENVIP), Instituto de Investigación Sanitaria de Santiago (IDIS) and Universidad de Santiago de Compostela (USC), 15706 Galicia, Spain.
Bello X; Unidade de Xenética, Instituto de Ciencias Forenses (INCIFOR), Facultade de Medicina, Universidade de Santiago de Compostela, 15782 Galicia, Spain.
Martinón-Torres F; GenPoB Research Group, Instituto de Investigaciones Sanitarias (IDIS), Hospital Clínico Universitario de Santiago (SERGAS), 15706 Galicia, Spain.
Salas A; Genetics, Vaccines and Pediatric Infectious Diseases Research Group (GENVIP), Instituto de Investigación Sanitaria de Santiago (IDIS) and Universidad de Santiago de Compostela (USC), 15706 Galicia, Spain.

Int J Mol Sci ; 21(8)2020 Apr 15.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32326627

Assuntos

Células Endoteliais/metabolismo; Fibroblastos/metabolismo; Monócitos/metabolismo; RNA Longo não Codificante/sangue; Viroses/metabolismo; Adulto; Povo Asiático; Biomarcadores/sangue; Biomarcadores/metabolismo; Pré-Escolar; Mineração de Dados; Regulação para Baixo; Células Endoteliais/microbiologia; Infecções por Escherichia coli/genética; Infecções por Escherichia coli/metabolismo; Fibroblastos/microbiologia; Células Endoteliais da Veia Umbilical Humana; Humanos; Influenza Humana/genética; Influenza Humana/metabolismo; Aprendizado de Máquina; México; Monócitos/microbiologia; Monócitos/virologia; RNA Longo não Codificante/genética; RNA Longo não Codificante/metabolismo; RNA-Seq; Infecções por Rotavirus/genética; Infecções por Rotavirus/metabolismo; Infecção pelo Vírus da Varicela-Zoster/genética; Infecção pelo Vírus da Varicela-Zoster/metabolismo; Viroses/genética; População Branca

Palavras-chave

RNA-seq; biomarkers; lncRNA; machine learning; virus

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Viroses / Monócitos / Células Endoteliais / Fibroblastos / RNA Longo não Codificante Limite: Adult / Child, preschool / Humans País/Região como assunto: Mexico Idioma: En Revista: Int J Mol Sci Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article País de afiliação: Espanha

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