SARS-CoV-2 Phylogenetic Analysis, Lazio Region, Italy, February-March 2020.

Bartolini, Barbara; Rueca, Martina; Gruber, Cesare Ernesto Maria; Messina, Francesco; Carletti, Fabrizio; Giombini, Emanuela; Lalle, Eleonora; Bordi, Licia; Matusali, Giulia; Colavita, Francesca; Castilletti, Concetta; Vairo, Francesco; Ippolito, Giuseppe; Capobianchi, Maria Rosaria; Di Caro, Antonino

Bartolini, Barbara; Rueca, Martina; Gruber, Cesare Ernesto Maria; Messina, Francesco; Carletti, Fabrizio; Giombini, Emanuela; Lalle, Eleonora; Bordi, Licia; Matusali, Giulia; Colavita, Francesca; Castilletti, Concetta; Vairo, Francesco; Ippolito, Giuseppe; Capobianchi, Maria Rosaria; Di Caro, Antonino.

Emerg Infect Dis ; 26(8): 1842-1845, 2020 08.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32459984

ABSTRACT

ABSTRACT

We report phylogenetic and mutational analysis of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 virus strains from the Lazio region of Italy and provide information about the dynamics of virus spread. Data suggest effective containment of clade V strains, but subsequently, multiple waves of clade G strains were circulating widely in Europe.

Assuntos

Betacoronavirus/genética; Infecções por Coronavirus/epidemiologia; Infecções por Coronavirus/transmissão; Pandemias; Filogenia; Pneumonia Viral/epidemiologia; Pneumonia Viral/transmissão; RNA Viral/genética; Adulto; Idoso; Betacoronavirus/classificação; Betacoronavirus/patogenicidade; Líquido da Lavagem Broncoalveolar/virologia; COVID-19; Teste para COVID-19; Técnicas de Laboratório Clínico/métodos; Infecções por Coronavirus/diagnóstico; Infecções por Coronavirus/virologia; Feminino; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Hospitalização; Humanos; Itália/epidemiologia; Masculino; Pessoa de Meia-Idade; Mutação; Nasofaringe/virologia; Pneumonia Viral/diagnóstico; Pneumonia Viral/virologia; Estudos Prospectivos; Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real; SARS-CoV-2; Índice de Gravidade de Doença; Fatores de Tempo

Palavras-chave

COVID-19; Italy; SARS-CoV-2; coronavirus disease; full genome sequence; phylogenetic tree; respiratory infections; severe acute respiratory syndrome coronavirus 2; viruses

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google

Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Filogenia / Pneumonia Viral / RNA Viral / Infecções por Coronavirus / Pandemias / Betacoronavirus Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Observational_studies / Risk_factors_studies Limite: Adult / Aged / Female / Humans / Male / Middle aged País/Região como assunto: Europa Idioma: En Revista: Emerg Infect Dis Assunto da revista: DOENCAS TRANSMISSIVEIS Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google