GC Content-Associated Sequencing Bias Caused by Library Preparation Method May Infrequently Affect <i>Salmonella</i> Serotype Prediction Using SeqSero2.

Li, Shaoting; Zhang, Shaokang; Deng, Xiangyu

GC Content-Associated Sequencing Bias Caused by Library Preparation Method May Infrequently Affect Salmonella Serotype Prediction Using SeqSero2.

Li, Shaoting; Zhang, Shaokang; Deng, Xiangyu.

Afiliação

Li S; Center for Food Safety, University of Georgia, Griffin, Georgia, USA.
Zhang S; Center for Food Safety, University of Georgia, Griffin, Georgia, USA.
Deng X; Center for Food Safety, University of Georgia, Griffin, Georgia, USA xdeng@uga.edu.

Appl Environ Microbiol ; 86(18)2020 09 01.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32680856

Assuntos

Salmonella; Composição de Bases; Biblioteca Gênica; Salmonella/genética; Sorogrupo; Sorotipagem

Palavras-chave

Nextera XT; Salmonella; SeqSero2; low GC; sequencing bias; serotype; version control

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Salmonella Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Revista: Appl Environ Microbiol Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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