A Protocol for Non-biased Identification of RNAs Transferred Between Heterologous Mammalian Cell Types Using RNA Tagging, Cell Sorting, and Sequencing.

Dasgupta, Sandipan; Gerst, Jeffrey E

Dasgupta, Sandipan; Gerst, Jeffrey E.

Afiliação

Dasgupta S; Department of Molecular Genetics, Weizmann Institute of Science, Rehovot, Israel.
Gerst JE; Department of Molecular Genetics, Weizmann Institute of Science, Rehovot, Israel. jeffrey.gerst@weizmann.ac.il.

Methods Mol Biol ; 2166: 195-214, 2020.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32710410

Assuntos

Actinas/genética; Separação Celular/métodos; Clonagem Molecular/métodos; Técnicas de Cocultura/métodos; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Levivirus/genética; RNA Mensageiro/genética; Animais; Transporte Biológico/genética; Comunicação Celular/genética; Linhagem Celular; Células Cultivadas; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/instrumentação; Humanos; Campos Magnéticos; Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa/métodos; Análise de Sequência de RNA/métodos

Palavras-chave

Co-culture; MACS; MS2; MS2-binding sequence; Magnetic sorting; Membrane nanotubes; RNA sequencing; RNA transfer; lncRNA; mRNA; miRNA; ß-Actin

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: RNA Mensageiro / Separação Celular / Actinas / Clonagem Molecular / Levivirus / Técnicas de Cocultura / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala Tipo de estudo: Diagnostic_studies Limite: Animals / Humans Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article País de afiliação: Israel

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