Molecular dynamics approach to identification of new OGG1 cancer-associated somatic variants with impaired activity.

Popov, Aleksandr V; Endutkin, Anton V; Yatsenko, Darya D; Yudkina, Anna V; Barmatov, Alexander E; Makasheva, Kristina A; Raspopova, Darya Yu; Diatlova, Evgeniia A; Zharkov, Dmitry O

Popov, Aleksandr V; Endutkin, Anton V; Yatsenko, Darya D; Yudkina, Anna V; Barmatov, Alexander E; Makasheva, Kristina A; Raspopova, Darya Yu; Diatlova, Evgeniia A; Zharkov, Dmitry O.

Afiliação

Popov AV; Laboratory of Genome and Protein Engineering, SB RAS Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Novosibirsk, Russia. Electronic address: apopov@niboch.nsc.ru.
Endutkin AV; Laboratory of Genome and Protein Engineering, SB RAS Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Novosibirsk, Russia.
Yatsenko DD; Laboratory of Genome and Protein Engineering, SB RAS Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Novosibirsk, Russia; Department of Natural Sciences, Novosibirsk State University, Novosibirsk, Russia.
Yudkina AV; Laboratory of Genome and Protein Engineering, SB RAS Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Novosibirsk, Russia.
Barmatov AE; Laboratory of Genome and Protein Engineering, SB RAS Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Novosibirsk, Russia.
Makasheva KA; Department of Natural Sciences, Novosibirsk State University, Novosibirsk, Russia.
Raspopova DY; Department of Natural Sciences, Novosibirsk State University, Novosibirsk, Russia.
Diatlova EA; Laboratory of Genome and Protein Engineering, SB RAS Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Novosibirsk, Russia.
Zharkov DO; Laboratory of Genome and Protein Engineering, SB RAS Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Novosibirsk, Russia; Department of Natural Sciences, Novosibirsk State University, Novosibirsk, Russia. Electronic address: dzharkov@niboch.nsc.ru.

J Biol Chem ; 296: 100229, 2021.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-33361155

Assuntos

DNA Glicosilases/química; Reparo do DNA; DNA de Neoplasias/química; Guanina/análogos & derivados; Mutação; Proteínas de Neoplasias/química; Substituição de Aminoácidos; Sítios de Ligação; Dano ao DNA; DNA Glicosilases/genética; DNA Glicosilases/metabolismo; DNA de Neoplasias/genética; DNA de Neoplasias/metabolismo; Expressão Gênica; Guanina/química; Guanina/metabolismo; Humanos; Cinética; Leucemia/enzimologia; Leucemia/genética; Leucemia/patologia; Neoplasias Pulmonares/enzimologia; Neoplasias Pulmonares/genética; Neoplasias Pulmonares/patologia; Simulação de Dinâmica Molecular; Proteínas de Neoplasias/genética; Proteínas de Neoplasias/metabolismo; Análise de Componente Principal; Ligação Proteica; Conformação Proteica em alfa-Hélice; Conformação Proteica em Folha beta; Domínios e Motivos de Interação entre Proteínas; Estrutura Terciária de Proteína; Carcinoma de Pequenas Células do Pulmão/enzimologia; Carcinoma de Pequenas Células do Pulmão/genética; Carcinoma de Pequenas Células do Pulmão/patologia

Palavras-chave

DNA damage; DNA glycosylases; DNA repair; OGG1; genetic polymorphism; molecular dynamics; personalized medicine; protein function prediction; structurefunction

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: DNA de Neoplasias / DNA Glicosilases / Reparo do DNA / Guanina / Mutação / Proteínas de Neoplasias Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: J Biol Chem Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article

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