Detalhe da pesquisa
1.
Anti-CRISPR prediction using deep learning reveals an inhibitor of Cas13b nucleases.
Mol Cell
; 82(14): 2714-2726.e4, 2022 07 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35649413
2.
Interrogating two extensively self-targeting Type I CRISPR-Cas systems in Xanthomonas albilineans reveals distinct anti-CRISPR proteins that block DNA degradation.
Nucleic Acids Res
; 52(2): 769-783, 2024 Jan 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38015466
3.
Improved discovery of RNA-binding protein binding sites in eCLIP data using DEWSeq.
Nucleic Acids Res
; 52(1): e1, 2024 Jan 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37962298
4.
A mutually exclusive stem-loop arrangement in roX2 RNA is essential for X-chromosome regulation in Drosophila.
Genes Dev
; 31(19): 1973-1987, 2017 10 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29066499
5.
Heterogenous nuclear ribonucleoprotein D-like controls endothelial cell functions.
Biol Chem
; 405(4): 229-239, 2024 Apr 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37942876
6.
RiboReport - benchmarking tools for ribosome profiling-based identification of open reading frames in bacteria.
Brief Bioinform
; 23(2)2022 03 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35037022
7.
RNA interaction format: a general data format for RNA interactions.
Bioinformatics
; 39(11)2023 11 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37944046
8.
Genome wide CRISPR screen for Pasteurella multocida toxin (PMT) binding proteins reveals LDL Receptor Related Protein 1 (LRP1) as crucial cellular receptor.
PLoS Pathog
; 18(12): e1010781, 2022 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36516199
9.
The role of the 5' sensing function of ribonuclease E in cyanobacteria.
RNA Biol
; 21(1): 1-18, 2024 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38469716
10.
Transformer-based tool recommendation system in Galaxy.
BMC Bioinformatics
; 24(1): 446, 2023 Nov 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38012574
11.
Peakhood: individual site context extraction for CLIP-seq peak regions.
Bioinformatics
; 38(4): 1139-1140, 2022 01 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34734974
12.
CRISPRtracrRNA: robust approach for CRISPR tracrRNA detection.
Bioinformatics
; 38(Suppl_2): ii42-ii48, 2022 09 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36124799
13.
DHX9 suppresses RNA processing defects originating from the Alu invasion of the human genome.
Nature
; 544(7648): 115-119, 2017 04 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28355180
14.
CRISPRidentify: identification of CRISPR arrays using machine learning approach.
Nucleic Acids Res
; 49(4): e20, 2021 02 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33290505
15.
Transcriptome-wide in vivo mapping of cleavage sites for the compact cyanobacterial ribonuclease E reveals insights into its function and substrate recognition.
Nucleic Acids Res
; 49(22): 13075-13091, 2021 12 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34871439
16.
CRISPRloci: comprehensive and accurate annotation of CRISPR-Cas systems.
Nucleic Acids Res
; 49(W1): W125-W130, 2021 07 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34133710
17.
Meta-Analysis of Mechano-Sensitive Ion Channels in Human Hearts: Chamber- and Disease-Preferential mRNA Expression.
Int J Mol Sci
; 24(13)2023 Jun 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37446137
18.
Robust and efficient single-cell Hi-C clustering with approximate k-nearest neighbor graphs.
Bioinformatics
; 37(22): 4006-4013, 2021 11 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34021764
19.
Scool: a new data storage format for single-cell Hi-C data.
Bioinformatics
; 37(14): 2053-2054, 2021 08 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33135074
20.
pyGenomeTracks: reproducible plots for multivariate genomic datasets.
Bioinformatics
; 37(3): 422-423, 2021 04 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32745185