Detalhe da pesquisa
1.
Revisiting Textbook Azide-Clock Reactions: A "Propeller-Crawling" Mechanism Explains Differences in Rates.
J Am Chem Soc
; 146(18): 12828-12835, 2024 May 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38687173
2.
LPATH: A Semiautomated Python Tool for Clustering Molecular Pathways.
J Chem Inf Model
; 63(24): 7610-7616, 2023 Dec 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38048485
3.
Mechanistic Insights into Passive Membrane Permeability of Drug-like Molecules from a Weighted Ensemble of Trajectories.
J Chem Inf Model
; 62(8): 1891-1904, 2022 04 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35421313
4.
A Minimal, Adaptive Binning Scheme for Weighted Ensemble Simulations.
J Phys Chem A
; 125(7): 1642-1649, 2021 Feb 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33577732
5.
The RED scheme: Rate-constant estimation from pre-steady state weighted ensemble simulations.
J Chem Phys
; 154(11): 114111, 2021 Mar 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33752378
6.
AI-driven multiscale simulations illuminate mechanisms of SARS-CoV-2 spike dynamics.
Int J High Perform Comput Appl
; 35(5): 432-451, 2021 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38603008
7.
A twist in the road less traveled: The AMBER ff15ipq-m force field for protein mimetics.
J Chem Phys
; 153(6): 064101, 2020 Aug 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35287464
8.
LPATH: A semi-automated Python tool for clustering molecular pathways.
bioRxiv
; 2023 Oct 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37645995
9.
A Suite of Tutorials for the WESTPA 2.0 Rare-Events Sampling Software [Article v2.0].
Living J Comput Mol Sci
; 5(1)2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37200895
10.
WESTPA 2.0: High-Performance Upgrades for Weighted Ensemble Simulations and Analysis of Longer-Timescale Applications.
J Chem Theory Comput
; 18(2): 638-649, 2022 Feb 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35043623
11.
The Next Frontier for Designing Switchable Proteins: Rational Enhancement of Kinetics.
J Phys Chem B
; 125(32): 9069-9077, 2021 08 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34324338
12.
A glycan gate controls opening of the SARS-CoV-2 spike protein.
Nat Chem
; 13(10): 963-968, 2021 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34413500
13.
A glycan gate controls opening of the SARS-CoV-2 spike protein.
bioRxiv
; 2021 May 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33619492
14.
A Suite of Tutorials for the WESTPA Rare-Events Sampling Software [Article v1.0].
Living J Comput Mol Sci
; 1(2)2019.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32395705