Detalhe da pesquisa
1.
A lethal mitonuclear incompatibility in complex I of natural hybrids.
Nature
; 626(7997): 119-127, 2024 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38200310
2.
Pandemic-scale phylogenomics reveals the SARS-CoV-2 recombination landscape.
Nature
; 609(7929): 994-997, 2022 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35952714
3.
Inferring multi-locus selection in admixed populations.
PLoS Genet
; 19(11): e1011062, 2023 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38015992
4.
Sex-linked gene traffic underlies the acquisition of sexually dimorphic UV color vision in Heliconius butterflies.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 120(33): e2301411120, 2023 08 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37552755
5.
Sequencing Illumina libraries at high accuracy on the ONT MinION using R2C2.
Genome Res
; 32(11-12): 2092-2106, 2022.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36351772
6.
Transposable elements drive intron gain in diverse eukaryotes.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 119(48): e2209766119, 2022 11 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36417430
7.
Horizontal transmission enables flexible associations with locally adapted symbiont strains in deep-sea hydrothermal vent symbioses.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 119(14): e2115608119, 2022 04 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35349333
8.
Neo-sex chromosome evolution shapes sex-dependent asymmetrical introgression barrier.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 119(19): e2119382119, 2022 05 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35512091
9.
Treenome Browser: co-visualization of enormous phylogenies and millions of genomes.
Bioinformatics
; 39(1)2023 01 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36453872
10.
Limited genomic signatures of population collapse in the critically endangered black abalone (Haliotis cracherodii).
Mol Ecol
; : e17362, 2024 Apr 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38682494
11.
Online Phylogenetics with matOptimize Produces Equivalent Trees and is Dramatically More Efficient for Large SARS-CoV-2 Phylogenies than de novo and Maximum-Likelihood Implementations.
Syst Biol
; 72(5): 1039-1051, 2023 11 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37232476
12.
Predicting transfer RNA gene activity from sequence and genome context.
Genome Res
; 30(1): 85-94, 2020 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31857444
13.
matOptimize: a parallel tree optimization method enables online phylogenetics for SARS-CoV-2.
Bioinformatics
; 38(15): 3734-3740, 2022 08 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35731204
14.
phastSim: Efficient simulation of sequence evolution for pandemic-scale datasets.
PLoS Comput Biol
; 18(4): e1010056, 2022 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35486906
15.
VGsim: Scalable viral genealogy simulator for global pandemic.
PLoS Comput Biol
; 18(8): e1010409, 2022 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36001646
16.
Horizontal transmission and recombination maintain forever young bacterial symbiont genomes.
PLoS Genet
; 16(8): e1008935, 2020 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32841233
17.
Stability of SARS-CoV-2 phylogenies.
PLoS Genet
; 16(11): e1009175, 2020 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33206635
18.
Inferring Adaptive Introgression Using Hidden Markov Models.
Mol Biol Evol
; 38(5): 2152-2165, 2021 05 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33502512
19.
A Daily-Updated Database and Tools for Comprehensive SARS-CoV-2 Mutation-Annotated Trees.
Mol Biol Evol
; 38(12): 5819-5824, 2021 12 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34469548
20.
Share pandemic sequences openly and fast.
Nature
; 591(7849): 202, 2021 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33658678