Toxoplasma gondii in the faeces of wild felids from the Atlantic Forest, Brazil.

BACKGROUND: Toxoplasma gondii is a apicomplexan parasite of virtually all warm-blooded species. All true cats (Felidae) can act as definitive hosts for this parasite by shedding resistant oocysts into the environment. However, the patterns of oocysts shedding are only partially understood in domestic cats and largely unknown in wild felids. OBJECTIVES: We carried out molecular analysis of 82 faecal samples from wild felids collected in the Serra dos Órgãos National Park (Parnaso), Rio de Janeiro, Brazil. METHODS: We screened samples for T. gondii DNA using a quantitative polymerase chain reaction (qPCR) targeting the 529bp DNA fragment. Polymerase chain reaction (PCR)-positive samples were genotyped using 15 microsatellite markers. RESULTS: Only one faecal sample from a Puma yagouaroundi was PCR-positive [cycle threshold (Ct) = 26.88]. This sample was contaminated by a T. gondii strain of BrIII lineage, a common lineage in domestic animals from Brazil. MAIN CONCLUSIONS: This first report of T. gondii in faeces of wild South American felids in their natural environment indicates infrequent oocyst shedding and suggests a role of acquired immunity in limiting re-excretion as in domestic cats. The presence of a domestic strain of T. gondii in a faecal sample from a wild felid at very low concentrations (not detected by microscopy) is consistent with the hypothesis of host-parasite co-adaptations limiting the circulation of T. gondii strains between domestic and wild environments.

The Program for Biodiversity Research in Brazil: The role of regional networks for biodiversity knowledge, dissemination, and conservation.

The Program for Biodiversity Research (PPBio) is an innovative program designed to integrate all biodiversity research stakeholders. Operating since 2004, it has installed long-term ecological research sites throughout Brazil and its logic has been applied in some other southern-hemisphere countries. The program supports all aspects of research necessary to understand biodiversity and the processes that affect it. There are presently 161 sampling sites (see some of them at Supplementary Appendix), most of which use a standardized methodology that allows comparisons across biomes and through time. To date, there are about 1200 publications associated with PPBio that cover topics ranging from natural history to genetics and species distributions. Most of the field data and metadata are available through PPBio web sites or DataONE. Metadata is available for researchers that intend to explore the different faces of Brazilian biodiversity spatio-temporal variation, as well as for managers intending to improve conservation strategies. The Program also fostered, directly and indirectly, local technical capacity building, and supported the training of hundreds of undergraduate and graduate students. The main challenge is maintaining the long-term funding necessary to understand biodiversity patterns and processes under pressure from global environmental changes.

Disentangling the veil line for Brazilian biodiversity: An overview from two long-term research programs reveals huge gaps in ecological data reporting.

The lack of synthesized information regarding biodiversity is a major problem among researchers, leading to a pervasive cycle where ecologists make field campaigns to collect information that already exists and yet has not been made available for a broader audience. This problem leads to long-lasting effects in public policies such as spending money multiple times to conduct similar studies in the same area. We aim to identify this knowledge gap by synthesizing information available regarding two Brazilian long-term biodiversity programs and the metadata generated by them. Using a unique dataset containing 1904 metadata, we identified patterns of metadata distribution and intensity of research conducted in Brazil, as well as where we should concentrate research efforts in the next decades. We found that the majority of metadata were about vertebrates, followed by plants, invertebrates, and fungi. Caatinga was the biome with least metadata, and that there's still a lack of information regarding all biomes in Brazil, with none of them being sufficiently sampled. We hope that these results will have implications for broader conservation and management guiding, as well as to funding allocation programs.

Gastrointestinal parasites among felids inhabiting the Serra dos Órgãos National Park, Rio de Janeiro, Brazil.

This study aimed to investigate the species of felids that inhabit the Serra dos Órgãos National Park (Parnaso) and gastrointestinal parasites at various stages of their life cycles in the feces of these animals. Between 2013 and 2015, felid feces were collected from trails in Parnaso. The sampling points were georeferenced. A total of 82 fecal samples were processed, of which 79 were collected on the ground, two from captured felids and one from a necropsied animal. All samples underwent coproparasitological techniques. Samples collected from the environment underwent additional trichological analysis. Fur patterns corresponding to Leopardus guttulus, Leopardus pardalis, Leopardus wiedii and Puma yagouaroundi were observed in 32 of the samples collected on the soil. High frequency of potentially parasitic evolving forms (88.6%) was observed in felid feces, particularly eggs of the family Diphyllobothriidae (68.6%). Besides, were also detected, eggs of superfamily Ascaridoidea (42.9%), nematode larvae (28.6%), eggs of order Strongylida (28.6%), Capillaria sp. (8.6%), Trichuris sp. (8.6%), eggs of order Spirurida (2.9%), unsporulated coccidian oocysts (8.6%) and Eimeria sp. (2.9%). Felid feces presented higher frequency of polyparasitism (60%) than monoparasitism (28.6%).

Potencial do Uso de Amostras Fecais de Felinos como Ferramenta de Monitoramento Ambiental: Estudo de Caso no Parque Nacional da Serra dos Órgãos / Potential of the use of Feline Fecal Samples as an Environmental Monitoring Tool: Case Study in Serra dos Órgãos National Park

O monitoramento das unidades de conservação (UCs) é fundamental para avaliar se atingem seus objetivos. Felinos são bons indicadores ambientais e suas fezes podem fornecer informações relevantes para o monitoramento de UCs. Utilizamos fezes encontradas em trilhas do Parque Nacional da Serra dos Órgãos para registrar a presença de felinos e outros mamíferos, analisamos sua distribuição espacial e discutimos o potencial do uso dessas amostras como ferramenta de monitoramento ambiental. Entre 2009 e 2019, foram coletadas 486 amostras em 21 trilhas. Foi possível identificar um mamífero em 61% das 315 amostras analisadas por microscopia óptica dos pelos-guarda. As cinco espécies de felinos com ocorrência confirmada no parque foram registradas, com destaque para o gato maracajá (Leopardus wiedii), frequentemente registrado em altitudes mais elevadas que o conhecido. Foram identificados mamíferos com poucos registros anteriores no parque, como o mão-pelada (Procyon cancrivorous). A distribuição espacial das amostras reflete a altimetria da área amostrada, com uma concentração nos campos de altitude, onde outros métodos têm-se mostrado menos eficazes no registro de mamíferos, destacando-se a importância de usar métodos complementares de monitoramento. Fezes podem ser utilizadas em análises moleculares, que, além de refinar a identificação taxonômica, podem desvendar informações como o grau de isolamento genético das populações. As fezes podem fornecer informações sobre a saúde animal através do estudo de parasitos gastrointestinais, que também são bons indicadores de qualidade ambiental e sobre contaminação ambiental. Apesar de seu potencial, o uso de fezes de felinos como ferramenta de monitoramento ainda é raro..

Toxoplasma gondii in the faeces of wild felids from the Atlantic Forest, Brazil

BACKGROUND Toxoplasma gondii is a apicomplexan parasite of virtually all warm-blooded species. All true cats (Felidae) can act as definitive hosts for this parasite by shedding resistant oocysts into the environment. However, the patterns of oocysts shedding are only partially understood in domestic cats and largely unknown in wild felids. OBJECTIVES We carried out molecular analysis of 82 faecal samples from wild felids collected in the Serra dos Órgãos National Park (Parnaso), Rio de Janeiro, Brazil. METHODS We screened samples for T. gondii DNA using a quantitative polymerase chain reaction (qPCR) targeting the 529bp DNA fragment. Polymerase chain reaction (PCR)-positive samples were genotyped using 15 microsatellite markers. RESULTS Only one faecal sample from a Puma yagouaroundi was PCR-positive [cycle threshold (Ct) = 26.88]. This sample was contaminated by a T. gondii strain of BrIII lineage, a common lineage in domestic animals from Brazil. MAIN CONCLUSIONS This first report of T. gondii in faeces of wild South American felids in their natural environment indicates infrequent oocyst shedding and suggests a role of acquired immunity in limiting re-excretion as in domestic cats. The presence of a domestic strain of T. gondii in a faecal sample from a wild felid at very low concentrations (not detected by microscopy) is consistent with the hypothesis of host-parasite co-adaptations limiting the circulation of T. gondii strains between domestic and wild environments.

Urban expansion in the Atlantic Forest: applying the Nature Futures Framework to develop a conceptual model and future scenarios / Expansão urbana na Mata Atlântica: aplicando o Nature Futures Framework para desenvolver um modelo conceitual e cenários futuros

Abstract: The Atlantic Forest is an important hotspot of biodiversity and ecosystem services that contributes to the well-being of its 125 million human inhabitants, about three quarters of the Brazilian population. In the coming decades, forecasts show that urban areas in the Atlantic Forest will grow at the expense of natural ecosystems, leading to increasing pressure on biodiversity and ecosystem services. We used the Nature Futures Framework (NFF) for envisioning positive scenarios for cities in the Atlantic Forest. First, we developed a conceptual model based on the Driver-Pressure-State-Impact-Response (DPSIR) approach to describe consequences of urban growth for the three NFF perspectives: Nature for Society, Nature for Nature and Nature as Culture. Second, we proposed scenario storylines that encompass multiple social-ecological values of nature and could be used by policy makers to plan desirable futures for the Atlantic Forest. Then, we discussed the impact of distinct policies on these values, identifying the different ways in which the management of urban green and blue spaces, natural ecosystems, and urban densities can lead to different social-ecological outcomes. We further detail the complexity, trade-offs, and synergies regarding city development, nature conservation, and human well-being in this tropical hotspot. Applying NFF can contribute to the ongoing debate regarding urban sustainability, by providing an interdisciplinary and integrative approach that explicitly incorporates multiple values of nature and the visualization of positive futures.

Resumo: A Mata Atlântica é um importante hotspot de biodiversidade e serviços ecossistêmicos que contribui para o bem-estar de seus 125 milhões de habitantes, cerca de três quartos da população brasileira. Nas próximas décadas, a previsão é de que as áreas urbanas na Mata Atlântica crescerão às custas de ecossistemas naturais, conduzindo a um aumento na pressão sobre a biodiversidade e os serviços ecossistêmicos. Nós usamos a perspectiva do Nature Futures Framework (NFF) para visualizar cenários positivos para as cidades na Mata Atlântica. Em primeiro lugar, desenvolvemos um modelo conceitual baseado na abordagem Driver-Pressure-State-Impact-Response (DPSIR) para descrever as consequências do crescimento urbano para as três perspectivas do NFF: Natureza para a Sociedade, Natureza para a Natureza, e Natureza como Cultura. Em seguida, propusemos cenários na forma de narrativas que abrangem múltiplos valores socioecológicos para a natureza, e que pudessem ser usados por tomadores de decisão para planejar futuros desejáveis para a Mata Atlântica. Posteriormente, discutimos os impactos de distintas políticas sob esses valores, identificando como diferentes maneiras de gerenciar os espaços urbanos verdes e azuis, os ecossistemas naturais, e as densidades urbanas podem conduzir a diferentes contextos socioecológicos. Ainda, nós detalhamos a complexidade, os trade-offs e as sinergias relacionados ao desenvolvimento de cidades, conservação da natureza e bem-estar humano neste hotspot tropical. A aplicação do NFF pode contribuir para o debate em andamento sobre sustentabilidade urbana, por meio do fornecimento de uma abordagem interdisciplinar e integrativa que explicitamente incorpora múltiplos valores da natureza e a visualização de futuros positivos.

Mamíferos do Parque Nacional da Serra dos Órgãos: atualização da lista de espécies e implicações para a conservação

A lista mais recente dos mamíferos que ocorrem no Parque Nacional da Serra dos Órgãos (PARNASO), com 79 registros, consta no seu segundo Plano de Manejo, publicado em 2008. O presente estudo teve como objetivo atualizar a lista de espécies de mamíferos do PARNASO, inserindo novos registros de espécies obtidos através de dados primários e revisão bibliográfica, considerando o período de 2002 a 2018. A revisão da lista do Plano de Manejo resultou em 75 registros válidos. Destes, três espécies foram consideradas localmente extintas (Panthera onca, Tayassu pecari e Tapirus terrestris) e não foram incluídas na presente lista. Desse modo, listamos aqui 100 espécies com registros recentes no PARNASO, o que representa um acréscimo de 28 espécies. As ordens com maior riqueza de espécies foram Rodentia e Chiroptera, com 32 e 23 espécies, respectivamente. Das espécies registradas, quatro são invasoras (Callithrix jacchus, C. penicillata, Rattus norvegicus e R. rattus), três são domésticas (Bos taurus, Canis familiaris e Felis catus), e 26 são ameaçadas de extinção. A análise da distribuição espacial da riqueza de espécies mostrou que apenas metade da área do parque possui ao menos um registro, e que os registros estão concentrados onde há infraestrutura para a pesquisa. A presença de espécies domésticas e invasoras, bem como as extinções locais detectadas, indicam a necessidade de ações de manejo no interior do parque. Esse grande acréscimo de espécies à lista evidencia o desenvolvimento da pesquisa com mamíferos nesta Unidade de Conservação e a necessidade de compilações mais frequentes dos resultados devido aos vários projetos em curso. O PARNASO tem papel de destaque na conservação de mamíferos ao ainda manter uma das maiores riquezas de espécies do Estado do Rio de Janeiro, e grande importância para a pesquisa, abrigando uma ampla gama de estudos e projetos de longa duração.

Gastrointestinal parasites among felids inhabiting the Serra dos Órgãos National Park, Rio de Janeiro, Brazil / Parasitos gastrintestinais em felídeos que habitam o Parque Nacional da Serra dos Órgãos, Rio de Janeiro, Brasil

Este estudo teve como objetivo pesquisar as espécies de felídeos que circulam no Parque Nacional da Serra dos Órgãos (Parnaso), bem como as formas evolutivas de parasitos gastrintestinais nas fezes desses animais. Entre 2013 e 2015, fezes de felídeos foram coletadas nas trilhas do Parnaso, sendo os pontos de coleta georeferenciados. Foram coletadas 82 amostras fecais, sendo 79 do ambiente, duas de felídeos capturados e uma de um animal necropsiado. Todas as amostras foram submetidas a técnicas coproparasitológicas, sendo as coletadas do ambiente também analisadas pela tricologia. Em 32 amostras coletadas do solo foram identificados padrões de pelos de Leopardus guttulus, Leopardus pardalis, Leopardus wiedii e Puma yagouaroundi. Elevada frequência de formas evolutivas potencialmente parasitárias (88,6%) foi evidenciada nas fezes dos felídeos, destacando os ovos da Família Diphyllobotrhiidae (68,6%). Além destes, também foram detectados, ovos da superfamília Ascaridoidea (42,9%), larvas de nematoides (28,6%), ovos da ordem Strongylida (28,6%), Capillaria sp. (8,6%), Trichuris sp. (8,6%), ovos da família Spirurida (2,9%), oocistos de coccídios não esporulados (8,6%) e Eimeria sp. (2,9%). As fezes dos felídeos apresentaram maior frequência de poliparasitismo (60%) que de monoparasitismo (28,6%).

Gastrointestinal parasites among felids inhabiting the Serra dos Órgãos National Park, Rio de Janeiro, Brazil / Parasitos gastrintestinais em felídeos que habitam o Parque Nacional da Serra dos Órgãos, Rio de Janeiro, Brasil

Abstract This study aimed to investigate the species of felids that inhabit the Serra dos Órgãos National Park (Parnaso) and gastrointestinal parasites at various stages of their life cycles in the feces of these animals. Between 2013 and 2015, felid feces were collected from trails in Parnaso. The sampling points were georeferenced. A total of 82 fecal samples were processed, of which 79 were collected on the ground, two from captured felids and one from a necropsied animal. All samples underwent coproparasitological techniques. Samples collected from the environment underwent additional trichological analysis. Fur patterns corresponding to Leopardus guttulus, Leopardus pardalis, Leopardus wiedii and Puma yagouaroundi were observed in 32 of the samples collected on the soil. High frequency of potentially parasitic evolving forms (88.6%) was observed in felid feces, particularly eggs of the family Diphyllobothriidae (68.6%). Besides, were also detected, eggs of superfamily Ascaridoidea (42.9%), nematode larvae (28.6%), eggs of order Strongylida (28.6%), Capillaria sp. (8.6%), Trichuris sp. (8.6%), eggs of order Spirurida (2.9%), unsporulated coccidian oocysts (8.6%) and Eimeria sp. (2.9%). Felid feces presented higher frequency of polyparasitism (60%) than monoparasitism (28.6%).

Resumo Este estudo teve como objetivo pesquisar as espécies de felídeos que circulam no Parque Nacional da Serra dos Órgãos (Parnaso), bem como as formas evolutivas de parasitos gastrintestinais nas fezes desses animais. Entre 2013 e 2015, fezes de felídeos foram coletadas nas trilhas do Parnaso, sendo os pontos de coleta georeferenciados. Foram coletadas 82 amostras fecais, sendo 79 do ambiente, duas de felídeos capturados e uma de um animal necropsiado. Todas as amostras foram submetidas a técnicas coproparasitológicas, sendo as coletadas do ambiente também analisadas pela tricologia. Em 32 amostras coletadas do solo foram identificados padrões de pelos de Leopardus guttulus , Leopardus pardalis, Leopardus wiedii e Puma yagouaroundi. Elevada frequência de formas evolutivas potencialmente parasitárias (88,6%) foi evidenciada nas fezes dos felídeos, destacando os ovos da Família Diphyllobotrhiidae (68,6%). Além destes, também foram detectados, ovos da superfamília Ascaridoidea (42,9%), larvas de nematoides (28,6%), ovos da ordem Strongylida (28,6%), Capillaria sp. (8,6%), Trichuris sp. (8,6%), ovos da família Spirurida (2,9%), oocistos de coccídios não esporulados (8,6%) e Eimeria sp. (2,9%). As fezes dos felídeos apresentaram maior frequência de poliparasitismo (60%) que de monoparasitismo (28,6%).