Detalhe da pesquisa
1.
MS2Rescore 3.0 Is a Modular, Flexible, and User-Friendly Platform to Boost Peptide Identifications, as Showcased with MS Amanda 3.0.
J Proteome Res
; 2024 Mar 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38491990
2.
MS Ana: Improving Sensitivity in Peptide Identification with Spectral Library Search.
J Proteome Res
; 22(2): 462-470, 2023 02 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36688604
3.
MS Annika 2.0 Identifies Cross-Linked Peptides in MS2-MS3-Based Workflows at High Sensitivity and Specificity.
J Proteome Res
; 22(9): 3009-3021, 2023 09 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37566781
4.
Toward an Integrated Machine Learning Model of a Proteomics Experiment.
J Proteome Res
; 22(3): 681-696, 2023 03 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36744821
5.
MS Annika: A New Cross-Linking Search Engine.
J Proteome Res
; 20(5): 2560-2569, 2021 05 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33852321
6.
Universal Spectrum Explorer: A Standalone (Web-)Application for Cross-Resource Spectrum Comparison.
J Proteome Res
; 20(6): 3388-3394, 2021 06 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33970638
7.
MS Amanda 2.0: Advancements in the standalone implementation.
Rapid Commun Mass Spectrom
; 35(11): e9088, 2021 Jun 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33759252
8.
The European Bioinformatics Community for Mass Spectrometry (EuBIC-MS): an open community for bioinformatics training and research.
Rapid Commun Mass Spectrom
; : e9087, 2021 Apr 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33861485
9.
PhoStar: Identifying Tandem Mass Spectra of Phosphorylated Peptides before Database Search.
J Proteome Res
; 17(1): 290-295, 2018 01 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29057658
10.
CharmeRT: Boosting Peptide Identifications by Chimeric Spectra Identification and Retention Time Prediction.
J Proteome Res
; 17(8): 2581-2589, 2018 08 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29863353
11.
Expanding the Use of Spectral Libraries in Proteomics.
J Proteome Res
; 17(12): 4051-4060, 2018 12 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30270626
12.
MS Amanda, a universal identification algorithm optimized for high accuracy tandem mass spectra.
J Proteome Res
; 13(8): 3679-84, 2014 Aug 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24909410
13.
Improved homology-driven computational validation of protein-protein interactions motivated by the evolutionary gene duplication and divergence hypothesis.
BMC Bioinformatics
; 10: 21, 2009 Jan 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19152684
14.
Proceedings of the EuBIC Winter School 2019.
EuPA Open Proteom
; 22-23: 4-7, 2019 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31890545
15.
Proceedings of the EuBIC developer's meeting 2018.
J Proteomics
; 187: 25-27, 2018 09 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29864591
16.
Proceedings of the EuBIC Winter School 2017.
J Proteomics
; 161: 78-80, 2017 05 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28385664
17.
Single Molecule Fluorescence Microscopy and Machine Learning for Rhesus D Antigen Classification.
Sci Rep
; 6: 32317, 2016 09 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27580632