Detalhe da pesquisa
1.
kb_DRAM: annotation and metabolic profiling of genomes with DRAM in KBase.
Bioinformatics
; 39(4)2023 04 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36857575
2.
The ModelSEED Biochemistry Database for the integration of metabolic annotations and the reconstruction, comparison and analysis of metabolic models for plants, fungi and microbes.
Nucleic Acids Res
; 49(D1): D575-D588, 2021 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32986834
3.
The ModelSEED Biochemistry Database for the integration of metabolic annotations and the reconstruction, comparison and analysis of metabolic models for plants, fungi and microbes.
Nucleic Acids Res
; 49(D1): D1555, 2021 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33179751
4.
Modeling central metabolism and energy biosynthesis across microbial life.
BMC Genomics
; 17: 568, 2016 Aug 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27502787
5.
Genome-scale metabolic reconstruction of 7,302 human microorganisms for personalized medicine.
Nat Biotechnol
; 41(9): 1320-1331, 2023 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36658342
6.
A functional microbiome catalog crowdsourced from North American rivers.
bioRxiv
; 2023 Jul 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37502915
7.
Application of the Metabolic Modeling Pipeline in KBase to Categorize Reactions, Predict Essential Genes, and Predict Pathways in an Isolate Genome.
Methods Mol Biol
; 2349: 291-320, 2022.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34719000
8.
Genome sequences of the biotechnologically important Bacillus megaterium strains QM B1551 and DSM319.
J Bacteriol
; 193(16): 4199-213, 2011 Aug.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21705586
9.
A genomic catalog of Earth's microbiomes.
Nat Biotechnol
; 39(4): 499-509, 2021 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33169036
10.
Draft Genome Sequence of 2-Methylpyridine-, 2-Ethylpyridine-, and 2-Hydroxypyridine-Degrading Arthrobacter sp. Strain ATCC 49987.
Microbiol Resour Announc
; 9(34)2020 Aug 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32816982
11.
Draft Genome Sequence of Pseudarthrobacter sp. Strain ATCC 49442 (Formerly Micrococcus luteus), a Pyridine-Degrading Bacterium.
Microbiol Resour Announc
; 9(38)2020 Sep 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32943555
12.
Publisher Correction: MEMOTE for standardized genome-scale metabolic model testing.
Nat Biotechnol
; 38(4): 504, 2020 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32265554
13.
Draft Genome Sequence of Enterobacter sp. Strain A8, a Carbazole-Degrading Bacterium.
Microbiol Resour Announc
; 8(18)2019 May 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31048380
14.
Draft Genome Sequence of Rhodococcus sp. Strain ATCC 49988, a Quinoline-Degrading Bacterium.
Microbiol Resour Announc
; 8(25)2019 Jun 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31221646
15.
Reconstruction and Analysis of Central Metabolism in Microbes.
Methods Mol Biol
; 1716: 111-129, 2018.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29222751
16.
Metabolic Reconstruction and Modeling Microbial Electrosynthesis.
Sci Rep
; 7(1): 8391, 2017 08 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28827682
17.
Evolution of substrate specificity in a retained enzyme driven by gene loss.
Elife
; 62017 03 31.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28362260
18.
Computing and Applying Atomic Regulons to Understand Gene Expression and Regulation.
Front Microbiol
; 7: 1819, 2016.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27933038
19.
Author Correction: A genomic catalog of Earth's microbiomes.
Nat Biotechnol
; 39(4): 521, 2021 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33795890
20.
Publisher Correction: A genomic catalog of Earth's microbiomes.
Nat Biotechnol
; 39(4): 520, 2021 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33208936