Ancient female philopatry, asymmetric male gene flow, and synchronous population expansion support the influence of climatic oscillations on the evolution of South American sea lion (Otaria flavescens).

The South American sea lion (Otaria flavescens) is widely distributed along the southern Atlantic and Pacific coasts of South America with a history of significant commercial exploitation. We aimed to evaluate the population genetic structure and the evolutionary history of South American sea lion along its distribution by analyses of mitochondrial DNA (mtDNA) and 10 nuclear microsatellites loci. We analyzed 147 sequences of mtDNA control region and genotyped 111 individuals of South American sea lion for 10 microsatellite loci, representing six populations (Peru, Northern Chile, Southern Chile, Uruguay (Brazil), Argentina and Falkland (Malvinas) Islands) and covering the entire distribution of the species. The mtDNA phylogeny shows that haplotypes from the two oceans comprise two very divergent clades as observed in previous studies, suggesting a long period (>1 million years) of low inter-oceanic female gene flow. Bayesian analysis of bi-parental genetic diversity supports significant (but less pronounced than mitochondrial) genetic structure between Pacific and Atlantic populations, although also suggested some inter-oceanic gene flow mediated by males. Higher male migration rates were found in the intra-oceanic population comparisons, supporting very high female philopatry in the species. Demographic analyses showed that populations from both oceans went through a large population expansion ~10,000 years ago, suggesting a very similar influence of historical environmental factors, such as the last glacial cycle, on both regions. Our results support the proposition that the Pacific and Atlantic populations of the South American sea lion should be considered distinct evolutionarily significant units, with at least two managements units in each ocean.

Population structure, phylogeography, and genetic diversity of the common bottlenose dolphin in the tropical and subtropical southwestern Atlantic Ocean

O objetivo deste estudo foi avaliar o nível de variabilidade genética e a estrutura populacional do golfinho-nariz-degarrafa (Tursiops truncatus) das porções tropical e subtropical do Oceano Atlântico Sul Ocidental e comparar os resultados com análises morfológicas prévias. Para tanto, analisamos 109 amostras de golfinhos-nariz-de-garrafa, as quais foram sequenciadas para a região controle do DNAmt e genotipadas para sete loci de microssatélites polimórficos. Os resultados sugerem que a espécie nessa região pode ser separada em duas grandes unidades biológicas, norte e sul, com uma área de parapatria no sul do Brasil. A unidade norte parece ocorrer em uma faixa de profundidade ampla, incluindo águas oceânicas. Esta unidade é consistente com a morfologia canônica de T. truncatus e pode ser dividida em três unidades de manejo: i) Arquipélago de São Pedro e São Paulo; ii) Norte e Nordeste do Brasil; iii) Bacia de Campos e Santos (que se estende pelo menos até o extremo sul do Brasil). A unidade sul é costeira, ocorrendo exclusivamente em águas muito rasas (< 10 m) e estuários. Esta unidade é consistente com descrições anteriores para Tursiops gephyreus (putativo). Entretanto, uma decisão formal sobre o status taxonômico de T. gephyreus deve aguardar estudos mais integrativos e geograficamente abrangentes.