Detalhe da pesquisa
1.
On the effects of selection and mutation on species tree inference.
Mol Phylogenet Evol
; 179: 107650, 2023 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36441104
2.
Comparative Performance of Popular Methods for Hybrid Detection using Genomic Data.
Syst Biol
; 70(5): 891-907, 2021 08 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33404632
3.
An invariants-based method for efficient identification of hybrid species from large-scale genomic data.
BMC Evol Biol
; 19(1): 112, 2019 05 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31146685
4.
SNP genotyping and parameter estimation in polyploids using low-coverage sequencing data.
Bioinformatics
; 34(3): 407-415, 2018 02 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29028881
5.
HyDe: A Python Package for Genome-Scale Hybridization Detection.
Syst Biol
; 67(5): 821-829, 2018 09 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29562307
6.
Bayesian inference of selection in the Wright-Fisher diffusion model.
Stat Appl Genet Mol Biol
; 17(3)2018 06 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29874197
7.
Split Scores: A Tool to Quantify Phylogenetic Signal in Genome-Scale Data.
Syst Biol
; 66(4): 620-636, 2017 07 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28123114
8.
Expected pairwise congruence among gene trees under the coalescent model.
Mol Phylogenet Evol
; 106: 144-150, 2017 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27693467
9.
Distribution of coalescent histories under the coalescent model with gene flow.
Mol Phylogenet Evol
; 105: 177-192, 2016 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27614251
10.
Gene tree rooting methods give distributions that mimic the coalescent process.
Mol Phylogenet Evol
; 70: 63-9, 2014 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24055603
11.
Using ancestral information to detect and localize quantitative trait loci in genome-wide association studies.
BMC Bioinformatics
; 14: 200, 2013 Jun 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23786262
12.
Effects of missing data on species tree estimation under the coalescent.
Mol Phylogenet Evol
; 69(3): 1057-62, 2013 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23769751
13.
Inferring species-level phylogenies and taxonomic distinctiveness using multilocus data in Sistrurus rattlesnakes.
Syst Biol
; 60(4): 393-409, 2011 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21389297
14.
Cryptic and abundant marine viruses at the evolutionary origins of Earth's RNA virome.
Science
; 376(6589): 156-162, 2022 04 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35389782
15.
Nuclear versus mitochondrial DNA: evidence for hybridization in colobine monkeys.
BMC Evol Biol
; 11: 77, 2011 Mar 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21435245
16.
Estimating species trees using approximate Bayesian computation.
Mol Phylogenet Evol
; 59(2): 354-63, 2011 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21397706
17.
Sources of error inherent in species-tree estimation: impact of mutational and coalescent effects on accuracy and implications for choosing among different methods.
Syst Biol
; 59(5): 573-83, 2010 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20833951
18.
STEM: species tree estimation using maximum likelihood for gene trees under coalescence.
Bioinformatics
; 25(7): 971-3, 2009 Apr 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19211573
19.
Letter to the editor on the article entitled "Estimating species trees using Approximate Bayesian Computation" (Fan and Kubatko, Mol. Phylogenetics Evol. 59, 354-363).
Mol Phylogenet Evol
; 66(1): 438-9, 2013 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23063884
20.
Accounting for genotype uncertainty in the estimation of allele frequencies in autopolyploids.
Mol Ecol Resour
; 16(3): 742-54, 2016 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26607217