Callitrichine gammaherpesvirus 3 and Human alphaherpesvirus 1 in New World Primate negative for yellow fever virus in Rio de Janeiro, Brazil.

BACKGROUND: Herpesvirus transmission between humans and non-human primate (NHP) can occur through contact scratches with lesions, infected saliva, and mainly through contaminated food. Therefore, cross-infection can lead to severe illness or even death for both the animal and human. In 2017, during the yellow fever (YF) outbreak in Brazil, species of the New World Primates (NWP) from Rio de Janeiro state, tested negative for yellow fever virus (YFV) detection. OBJECTIVES: To evaluate herpesvirus in the population NWP in Rio de Janeiro. METHODS: To investigate, liver samples of 283 NWP, from several regions of the state of Rio de Janeiro, were tested for the herpesvirus family using a Pan-polymerase chain reaction (Pan-PCR) and sequencing. FINDINGS: 34.6% (98/283) tested positive for at least one herpesvirus; 29.3% (83/283) tested positive to Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1), this virus from humans can be lethal to New World monkey; 13% (37/283) were detected Callitrichine gammaherpesvirus 3 (CalHV-3), responsible for lymphoproliferative disease that can be fatal in NWP. In addition, CalHV-3 / HSV-1 co-infection was in 11.6% (33/283) of the samples. MAIN CONCLUSIONS: Pan-herpesvirus was useful to identify species-specific herpesviruses and virus from human that can infect animals. Furthermore, during an outbreak of YF other infections should be monitored.

Human Gammaherpesvirus 8 Oncogenes Associated with Kaposi's Sarcoma.

Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus (KSHV), also known as human gammaherpesvirus 8 (HHV-8), contains oncogenes and proteins that modulate various cellular functions, including proliferation, differentiation, survival, and apoptosis, and is integral to KSHV infection and oncogenicity. In this review, we describe the most important KSHV genes [ORF 73 (LANA), ORF 72 (vCyclin), ORF 71 or ORFK13 (vFLIP), ORF 74 (vGPCR), ORF 16 (vBcl-2), ORF K2 (vIL-6), ORF K9 (vIRF 1)/ORF K10.5, ORF K10.6 (vIRF 3), ORF K1 (K1), ORF K15 (K15), and ORF 36 (vPK)] that have the potential to induce malignant phenotypic characteristics of Kaposi's sarcoma. These oncogenes can be explored in prospective studies as future therapeutic targets of Kaposi's sarcoma.

Update of the global distribution of human gammaherpesvirus 8 genotypes.

Human gammaherpesvirus 8 (HHV-8) consists of six major clades (A-F) based on the genetic sequence of the open reading frame (ORF)-K1. There are a few conflicting reports regarding the global distribution of the different HHV-8 genotypes. This study aimed to determine the global distribution of the different HHV-8 genotypes based on phylogenetic analysis of the ORF-K1 coding region using sequences published in the GenBank during 1997-2020 and construct a phylogenetic tree using the maximum likelihood algorithm with the GTR + I + G nucleotide substitution model. A total of 550 sequences from 38 countries/origins were analysed in this study. Genotypes A and C had similar global distributions and were prevalent in Africa and Europe. Genotype B was prevalent in Africa. Of the rare genotypes, genotype D was reported in East Asia and Oceania and genotype E in South America, while genotype F was prevalent in Africa. The highest genotypic diversity was reported in the American continent, with Brazil housing five HHV-8 genotypes (A, B, C, E, and F). In this study, we present update of the global distribution of HHV-8 genotypes, providing a basis for future epidemiological and evolutionary studies of HHV-8.

The Torque Teno Virus Titer in Saliva Reflects the Level of Circulating CD4+ T Lymphocytes and HIV in Individuals Undergoing Antiretroviral Maintenance Therapy.

INTRODUCTION: Torque teno virus (TTV) is a non-pathogenic virus present in body fluids. Its titer in the circulation increases in association with immune suppression, such as in HIV-infected individuals. We evaluated if the TTV titer in saliva from HIV-positive individuals undergoing antiretroviral therapy (ART) was related to the circulating CD4+ T lymphocyte concentration and the HIV titer. METHODS: Saliva was collected from 276 asymptomatic individuals undergoing ART, and an additional 48 individuals positive for AIDS-associated Kaposi's Sarcoma (AIDS-KS). The salivary TTV titer was measured by gene amplification analysis. The circulating CD4+ T lymphocyte and HIV levels were obtained by chart review. RESULTS: TTV was detectable in saliva from 80% of the asymptomatic subjects and 87% of those with AIDS-KS. In the asymptomatic group the median log10 TTV titer/ml was 3.3 in 200 males vs. 2.4 in 76 females (p < 0.0001). TTV titer/ml was 3.7 when HIV was acquired by intravenous drug usage, 3.2 when by sexual acquisition and 2.4 when blood transfusion acquired. The salivary TTV titer was inversely correlated with the circulating CD4+ T lymphocyte level (p < 0.0001) and positively correlated with the circulating HIV concentration (p = 0.0005). The median salivary TTV titer and circulating HIV titer were higher, and the CD4+ count was lower, in individuals positive for AIDS-KS than in the asymptomatic subjects (p < 0.0001). CONCLUSION: The TTV titer in saliva is a potential biomarker for monitoring immune status in individuals undergoing ART.

Genotypic Characterization of Herpes Simplex Virus Type 1 Isolates in Immunocompromised Patients in Rio de Janeiro, Brazil.

Herpes simplex virus type 1 (HSV-1) is a prevalent human pathogen that causes a variety of diseases, including an increased risk of developing more severe disease in HIV-infected individuals. In Brazil, there is no information about the molecular epidemiology of HSV-1 infection, especially in HIV-infected individuals. The aim of this study was to perform the genotypic characterization of HSV-1 among HIV-infected patients. A total of 214 serum samples from HIV-positive patients without HSV infection symptoms were enrolled in one of two reference hospitals for HIV infection managing in Rio de Janeiro. The gG and gI genes were analyzed by restriction fragment length polymorphism (RFLP) and full nucleotide sequencing of the US8 (1601 bp), UL44 (1996 bp), and UL23 (1244 bp) regions was performed. A total of 38.3% (82/214) and 32.7% (70/214) of the serum samples tested positive for gG and gI genes, respectively. RFLP analysis classified the HSV-1 as belonging to genotype A. Phylogenetic analysis of the Brazilian samples for the US8, UL44, and UL23 regions demonstrated that the nucleotide identity between Brazilian samples was higher than 97% for all genes. No acyclovir mutation was detected in the patients. The shedding of HSV in the serum samples from HIV-positive patients who were asymptomatic for HSV infection was detected in this work. This is the first report of molecular characterization of HSV-1 in Brazilian samples since there is no previous data available in the literature concerning the genotypic classification and stable distribution of Brazilian strains of HSV-1 in Rio de Janeiro, Brazil.

Epidemiologia e diversidade genética do Gammaherpesvírus humano 8 no Brasil e no mundo

O Gammaherpesvírus humano 8 (HHV-8) está associado a várias neoplasias que podem ocorrer em indivíduos infectados pelo Vírus da imunodeficiência humana (HIV), como mulheres grávidas coinfectadas com HIV/HHV-8. Essas gestantes apresentam alto risco de desenvolvimento de neoplasias associadas, como sarcoma de Kaposi (SK), além de aumento da carga viral e transmissão vertical desses vírus. O HHV-8 consiste em seis clados principais (A-F) com base na sequência genética da fase de leitura aberta (ORF) K1. Esses clados exibem claro agrupamento entre indivíduos de diferentes grupos étnicos e de diferentes regiões geográficas. No entanto, existem relatos conflitantes sobre a distribuição global dos diferentes genótipos do HHV-8, incluindo as informações sobre os genótipos do HHV-8 que circulam atualmente no Brasil, país com população humana que varia muito na etnia. Os objetivos deste estudo foram (i) estimar a prevalência da infecção causada por HHV-8 em gestantes portadoras de HIV no Rio de Janeiro, Brasil; (ii) caracterizar isolados de HHV-8 de pacientes com HIV/SK residindo no Brasil baseado na análise filogenética da região codificadora da ORF K1 e (iii) analisar as origens putativas desses isolados; e (iv) determinar a distribuição mundial dos diferentes genótipos do HHV-8 com base na análise filogenética da região codificadora da ORF K1. Como principais resultados, destacamos: (i) a baixa soroprevalência do HHV-8 em gestantescom HIV residentes no Brasil; (ii) a identificação dos genótipos A, B e C presentes empacientes brasileiros com HIV/SK; (iii) a identificação das origens putativas desses isolados: os isolados de HHV8/A parecem estar associados a vírus detectados da Ucrânia, Rússia e do grupo étnico tártaro; os isolados de HHV-8/B parecem estar associados a vírus detectados do Congo e da República Democrática do Congo; e os isolados de HHV-8/C parecem estar associados a vírus detectados da Austrália, Argélia, Inglaterra e Guiana Francesa; (iv) a descrição da distribuição global dos genótipos HHV-8, no qual os genótipos A e C estão presentes em todos os continentes, mas são altamenteprevalentes na Europa e na África; o genótipo B é mais prevalente na África, mas também foi identificado na América Central e do Sul e na Europa; o genótipo D é raroe foi relatado no Leste Asiático e na Oceania; o genótipo incomum E foi identificado em populações ameríndias na América do Sul; e o genótipo F também é raro, mas foiidentificado na África, América e Europa; e (v) a identificação do Brasil sendo o país com maior diversidade de genótipos de HHV-8 do mundo, apresentando cinco genótipos (A, B, C, E e F). Esses resultados fornecem novas informações sobre a epidemiologia e a diversidade do HHV-8 no Brasil e no mundo, fornecendo uma base para futuros estudos epidemiológicos e evolutivos do HHV-8.

Prevalência das infecções causadas por herpesvírus humanos em portadores do HIV através de diagnóstico diferencial

Os herpesvírus humanos (HHV) (herpes simples 1 e 2, varicella-zoster, Epstein-Barr, citomegalovírus humano, herpesvírus humanos 6A, 6B, 7 e 8) estão associados à diversas doenças, porém são nos indivíduos portadores do vírus da imunodeficiência humana (HIV) que estes herpesvírus causam infecção grave e duradoura, podendo levá-los ao óbito. Contudo, no Brasil, pouco é conhecido sobre a verdadeira prevalência das infecções causadas por HHV nesses indivíduos devido a poucos estudos realizados no país. Portanto, este trabalho visou determinar a prevalência desta co-infecção HIV/Herpesvírus humanos através de um diagnóstico diferencial que detecta simultaneamente as nove espécieis de HHV (Pan-herpesvírus). Este método é baseado na amplificação, por reação em cadeia da polimerase (PCR) Nested, de uma região altamente conservada (DPOL) do genoma desses vírus e na identificação da espécie viral por sequenciamento do genoma viral. Além disso, este estudo visou avaliar possíveis fatores associados com a prevalência desta co-infecção, como sexo, idade e taxas de linfócitos T CD4+ (LT CD4+), e destinou-se comparar a prevalência das infecções causadas por HHV entre indivíduos HIV reagentes (grupo teste) e indivíduos não reagentes para este vírus (grupo controle). Para isso, 241 amostras de soro de indivíduos portadores do HIV coletadas durante os anos de 2012 (95 amostras), 2013 (89 amostras) e 2014 (57 amostras), e 94 amostras de soro de indivíduos HIV não reagentes coletadas durante o ano de 2013 foram testadas através de PCR Nested As amostras amplificadas foram sequenciadas para a identificação da espécie viral. Com isso, neste estudo foi encontrada prevalência da co-infecção HIV/HHV de 14,1% (34/241), sendo 13% (31/241), 0,8% (2/241) e 0,4% (1/241) relacionado às co-infecções HIV/HSV-1, HIV/HHV-6 e HIV/HHV-8, respectivamente. Também foi observada diminuição estatisticamente significativa (p-valor < 0,0001) da prevalência da co-infecção HIV/HHV durante os anos estudados. Já o grupo controle obteve menor prevalência da infecção causada por HHV (1,1%; 1/94) e foi referente à infecção causada por HHV-6. Ademais, foi verificada associação estatisticamente significativa da detecção da co-infecção HIV/HSV-1 com as taxas de LT CD4+, evidenciando que a taxa LT CD4+ <500 células/mm³ é um fator de risco para infecções causadas por HSV-1 em indivíduos HIV reagentes (p-valor < 0,0327/ p-valor <0,0186). A partir disto, foi verificado que o Pan-herpesvírus foi eficiente na detecção das co-infecções HIV/HSV-1, HIV/HHV-6 e HIV/HHV-8. Sendo assim, este trabalho contribuiu para a investigação da prevalência das infecções causadas por herpesvírus humanos em indivíduos HIV reagentes no Rio de Janeiro/Brasil

CRISPR / Cas-9 Vector System: Targets UL-39 and Inhibits HSV-1 Replication in Vitro

HSV-1 affects approximately 67% of the world population. Here, we sought to use the CRISPR / Cas9 system with the UL39 target, essential for virus replication. The sgRNA sequence was inserted into plasmid (PX459-UL39). Vero cells were transfected with PX459-UL39, and inhibition of viral replication was assessed 24 and 48 hours later using plaque assays and fluorescence and qPCR. Fluorescence analyzes revealed the presence of anti-HSV-1 CRISPR/Cas9 within Vero cells, and qPCR showed that the viral load decreased by> 95% of cells transfected with anti-HSV-1 CRISPR / Cas9. Our data demonstrate the usefulness of the PX459-UL39 to inhibit HSV-1 infection.