Detalhe da pesquisa
1.
The genomic basis of evolutionary differentiation among honey bees.
Genome Res
; 31(7): 1203-1215, 2021 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33947700
2.
Galba: genome annotation with miniprot and AUGUSTUS.
BMC Bioinformatics
; 24(1): 327, 2023 Aug 31.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37653395
3.
End-to-end learning of evolutionary models to find coding regions in genome alignments.
Bioinformatics
; 38(7): 1857-1862, 2022 03 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35060608
4.
Global, highly specific and fast filtering of alignment seeds.
BMC Bioinformatics
; 23(1): 225, 2022 Jun 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35689182
5.
TSEBRA: transcript selector for BRAKER.
BMC Bioinformatics
; 22(1): 566, 2021 Nov 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34823473
6.
Comparative Annotation Toolkit (CAT)-simultaneous clade and personal genome annotation.
Genome Res
; 28(7): 1029-1038, 2018 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29884752
7.
Repeat associated mechanisms of genome evolution and function revealed by the Mus caroli and Mus pahari genomes.
Genome Res
; 28(4): 448-459, 2018 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29563166
8.
Enhanced genome assembly and a new official gene set for Tribolium castaneum.
BMC Genomics
; 21(1): 47, 2020 Jan 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31937263
9.
Wild tobacco genomes reveal the evolution of nicotine biosynthesis.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 114(23): 6133-6138, 2017 06 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28536194
10.
VARUS: sampling complementary RNA reads from the sequence read archive.
BMC Bioinformatics
; 20(1): 558, 2019 Nov 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31703556
11.
Effects of adult temperature on gene expression in a butterfly: identifying pathways associated with thermal acclimation.
BMC Evol Biol
; 19(1): 32, 2019 01 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30674272
12.
The house spider genome reveals an ancient whole-genome duplication during arachnid evolution.
BMC Biol
; 15(1): 62, 2017 07 31.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28756775
13.
Matching phenotypes to whole genomes: Lessons learned from four iterations of the personal genome project community challenges.
Hum Mutat
; 38(9): 1266-1276, 2017 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28544481
14.
House spider genome uncovers evolutionary shifts in the diversity and expression of black widow venom proteins associated with extreme toxicity.
BMC Genomics
; 18(1): 178, 2017 02 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28209133
15.
BRAKER1: Unsupervised RNA-Seq-Based Genome Annotation with GeneMark-ET and AUGUSTUS.
Bioinformatics
; 32(5): 767-9, 2016 03 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26559507
16.
Simultaneous gene finding in multiple genomes.
Bioinformatics
; 32(22): 3388-3395, 2016 11 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27466621
17.
The Amphimedon queenslandica genome and the evolution of animal complexity.
Nature
; 466(7307): 720-6, 2010 Aug 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20686567
18.
Combining features in a graphical model to predict protein binding sites.
Proteins
; 83(5): 844-52, 2015 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25663045
19.
Large scale RNAi screen in Tribolium reveals novel target genes for pest control and the proteasome as prime target.
BMC Genomics
; 16: 674, 2015 Sep 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26334912
20.
The genome of the blood fluke Schistosoma mansoni.
Nature
; 460(7253): 352-8, 2009 Jul 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19606141