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J Virol Methods ; 328: 114968, 2024 Jul.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38796133

RESUMO

Dengue fever, a mosquito-borne viral disease of significant public health concern in tropical and subtropical regions, is caused by any of the four serotypes of the dengue virus (DENV1-4). Cutting-edge technologies like next-generation sequencing (NGS) are revolutionizing virology, enabling in-depth exploration of DENV's genetic diversity. Here, we present an optimized workflow for full-genome sequencing of DENV 1-4 utilizing tiled amplicon multiplex PCR and Illumina sequencing. Our assay, sequenced on the Illumina MiSeq platform, demonstrates its ability to recover the full-length dengue genome across various viral abundances in clinical specimens with high-quality base coverage. This high quality underscores its suitability for precise examination of intra-host diversity, enriching our understanding of viral evolution and holding potential for improved diagnostic and intervention strategies in regions facing dengue outbreaks.


Assuntos
Vírus da Dengue , Dengue , Genoma Viral , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala , Reação em Cadeia da Polimerase Multiplex , Sorogrupo , Sequenciamento Completo do Genoma , Vírus da Dengue/genética , Vírus da Dengue/classificação , Vírus da Dengue/isolamento & purificação , Reação em Cadeia da Polimerase Multiplex/métodos , Dengue/virologia , Dengue/diagnóstico , Humanos , Genoma Viral/genética , Sequenciamento Completo do Genoma/métodos , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos , RNA Viral/genética
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