Detalhe da pesquisa
1.
CNAViz: An interactive webtool for user-guided segmentation of tumor DNA sequencing data.
PLoS Comput Biol
; 18(10): e1010614, 2022 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36228003
2.
Identifying tumor clones in sparse single-cell mutation data.
Bioinformatics
; 36(Suppl_1): i186-i193, 2020 07 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32657385
3.
Phenol removal by laccases and other phenol oxidases of Pleurotus sajor-caju PS-2001 in submerged cultivations and aqueous mixtures.
J Environ Manage
; 236: 581-590, 2019 Apr 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30771677
4.
HapCHAT: adaptive haplotype assembly for efficiently leveraging high coverage in long reads.
BMC Bioinformatics
; 19(1): 252, 2018 07 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29970002
5.
HapCol: accurate and memory-efficient haplotype assembly from long reads.
Bioinformatics
; 32(11): 1610-7, 2016 06 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26315913
6.
CONIPHER: a computational framework for scalable phylogenetic reconstruction with error correction.
Nat Protoc
; 19(1): 159-183, 2024 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38017136
7.
HATCHet2: clone- and haplotype-specific copy number inference from bulk tumor sequencing data.
Genome Biol
; 25(1): 130, 2024 May 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38773520
8.
On the inversion-indel distance.
BMC Bioinformatics
; 14 Suppl 15: S3, 2013.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24564182
9.
Insights into the metastatic cascade through research autopsies.
Trends Cancer
; 9(6): 490-502, 2023 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37059687
10.
HATCHet2: clone- and haplotype-specific copy number inference from bulk tumor sequencing data.
bioRxiv
; 2023 Jul 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37502835
11.
Structurally Complex Osteosarcoma Genomes Exhibit Limited Heterogeneity within Individual Tumors and across Evolutionary Time.
Cancer Res Commun
; 3(4): 564-575, 2023 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37066022
12.
Quantifying the impact of immunotherapy on RNA dynamics in cancer.
J Immunother Cancer
; 11(11)2023 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37914385
13.
Subclonal somatic copy number alterations emerge and dominate in recurrent osteosarcoma.
bioRxiv
; 2023 Jan 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36711976
14.
Subclonal Somatic Copy-Number Alterations Emerge and Dominate in Recurrent Osteosarcoma.
Cancer Res
; 83(22): 3796-3812, 2023 11 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37812025
15.
Evolutionary characterization of lung adenocarcinoma morphology in TRACERx.
Nat Med
; 29(4): 833-845, 2023 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37045996
16.
Parsimonious Clone Tree Integration in cancer.
Algorithms Mol Biol
; 17(1): 3, 2022 Mar 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35282838
17.
The translational challenges of precision oncology.
Cancer Cell
; 40(5): 458-478, 2022 05 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35487215
18.
Characterizing allele- and haplotype-specific copy numbers in single cells with CHISEL.
Nat Biotechnol
; 39(2): 207-214, 2021 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32879467
19.
DeCiFering the elusive cancer cell fraction in tumor heterogeneity and evolution.
Cell Syst
; 12(10): 1004-1018.e10, 2021 10 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34416171
20.
Comprehensive characterization of 536 patient-derived xenograft models prioritizes candidatesfor targeted treatment.
Nat Commun
; 12(1): 5086, 2021 08 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34429404