Detalhe da pesquisa
1.
Gene Expression Changes and Community Turnover Differentially Shape the Global Ocean Metatranscriptome.
Cell
; 179(5): 1068-1083.e21, 2019 Nov 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31730850
2.
Microbiota-dependent activation of the myeloid calcineurin-NFAT pathway inhibits B7H3- and B7H4-dependent anti-tumor immunity in colorectal cancer.
Immunity
; 55(4): 701-717.e7, 2022 04 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35364006
3.
Bacterial retrons encode phage-defending tripartite toxin-antitoxin systems.
Nature
; 609(7925): 144-150, 2022 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35850148
4.
Biosynthetic potential of the global ocean microbiome.
Nature
; 607(7917): 111-118, 2022 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35732736
5.
Unravelling the collateral damage of antibiotics on gut bacteria.
Nature
; 599(7883): 120-124, 2021 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34646011
6.
Identifying temporal and spatial patterns of variation from multimodal data using MEFISTO.
Nat Methods
; 19(2): 179-186, 2022 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35027765
7.
proGenomes3: approaching one million accurately and consistently annotated high-quality prokaryotic genomes.
Nucleic Acids Res
; 51(D1): D760-D766, 2023 01 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36408900
8.
PyHMMER: a Python library binding to HMMER for efficient sequence analysis.
Bioinformatics
; 39(5)2023 05 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37074928
9.
Extensive impact of non-antibiotic drugs on human gut bacteria.
Nature
; 555(7698): 623-628, 2018 03 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29555994
10.
A faecal microbiota signature with high specificity for pancreatic cancer.
Gut
; 71(7): 1359-1372, 2022 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35260444
11.
Depression and fatigue in active IBD from a microbiome perspective-a Bayesian approach to faecal metagenomics.
BMC Med
; 20(1): 366, 2022 10 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36244970
12.
proGenomes2: an improved database for accurate and consistent habitat, taxonomic and functional annotations of prokaryotic genomes.
Nucleic Acids Res
; 48(D1): D621-D625, 2020 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31647096
13.
The gut microbiome in solid organ transplantation.
Pediatr Transplant
; 24(7): e13866, 2020 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32997434
14.
Subspecies in the global human gut microbiome.
Mol Syst Biol
; 13(12): 960, 2017 12 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29242367
15.
CART-a chemical annotation retrieval toolkit.
Bioinformatics
; 32(18): 2869-71, 2016 09 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27256313
16.
MOCAT2: a metagenomic assembly, annotation and profiling framework.
Bioinformatics
; 32(16): 2520-3, 2016 08 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27153620
17.
Accurate and universal delineation of prokaryotic species.
Nat Methods
; 10(9): 881-4, 2013 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23892899
18.
Metagenomic species profiling using universal phylogenetic marker genes.
Nat Methods
; 10(12): 1196-9, 2013 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24141494
19.
Oqtans: the RNA-seq workbench in the cloud for complete and reproducible quantitative transcriptome analysis.
Bioinformatics
; 30(9): 1300-1, 2014 May 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24413671
20.
Potential of fecal microbiota for early-stage detection of colorectal cancer.
Mol Syst Biol
; 10: 766, 2014 Nov 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25432777