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Shotgun metagenomic sequencing of the first case of monkeypox virus in Brazil, 2022
Claro, Ingra Morales; Romano, Camila Malta; Candido, Darlan da Silva; Lima, Evelyn Lepka de; Lindoso, José Angelo Lauletta; Ramundo, Mariana Severo; Moreira, Filipe Romero Rebello; Barra, Luiz Alberto Costa; Borges, Luciana Marques Sansão; Medeiros, Lucas Alberto; Tomishige, Marcia Y. S.; Moutinho, Tomas; Silva, Anderson José Dias da; Rodrigues, Camila Cristina Martini; Azevedo, Luiz Cesar Fernandes de; Villas-Boas, Lucy Santos; Silva, Camila Alves Maia da; Coletti, Thaís Moura; Manuli, Erika R.; OToole, Aine; Quick, Joshua; Loman, Nicholas; Rambaut, Andrew; Faria, Nuno R.; Figueiredo-Mello, Claudia; Sabino, Ester Cerdeira.
Afiliação
  • Claro, Ingra Morales; Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina. Instituto de Medicina Tropical de São Paulo. São Paulo. BR
  • Romano, Camila Malta; Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina. Instituto de Medicina Tropical de São Paulo. São Paulo. BR
  • Candido, Darlan da Silva; Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina. Instituto de Medicina Tropical de São Paulo. São Paulo. BR
  • Lima, Evelyn Lepka de; Instituto de Infectologia Emílio Ribas. São Paulo. BR
  • Lindoso, José Angelo Lauletta; Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina. Instituto de Medicina Tropical de São Paulo. São Paulo. BR
  • Ramundo, Mariana Severo; Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina. Instituto de Medicina Tropical de São Paulo. São Paulo. BR
  • Moreira, Filipe Romero Rebello; Imperial College London. MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis. London. GB
  • Barra, Luiz Alberto Costa; Instituto de Infectologia Emílio Ribas. São Paulo. BR
  • Borges, Luciana Marques Sansão; Instituto de Infectologia Emílio Ribas. São Paulo. BR
  • Medeiros, Lucas Alberto; Instituto de Infectologia Emílio Ribas. São Paulo. BR
  • Tomishige, Marcia Y. S.; Instituto de Infectologia Emílio Ribas. São Paulo. BR
  • Moutinho, Tomas; Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina. Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias. São Paulo. BR
  • Silva, Anderson José Dias da; Instituto de Infectologia Emílio Ribas. São Paulo. BR
  • Rodrigues, Camila Cristina Martini; Instituto de Infectologia Emílio Ribas. São Paulo. BR
  • Azevedo, Luiz Cesar Fernandes de; Instituto de Infectologia Emílio Ribas. São Paulo. BR
  • Villas-Boas, Lucy Santos; Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina. Instituto de Medicina Tropical de São Paulo. São Paulo. BR
  • Silva, Camila Alves Maia da; Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina. Instituto de Medicina Tropical de São Paulo. São Paulo. BR
  • Coletti, Thaís Moura; Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina. Instituto de Medicina Tropical de São Paulo. São Paulo. BR
  • Manuli, Erika R.; Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina. Instituto de Medicina Tropical de São Paulo. São Paulo. BR
  • OToole, Aine; University of Edinburgh. Institute of Ecology and Evolution. Edinburgh. GB
  • Quick, Joshua; University of Birmingham. School of Biosciences. Birmingham. GB
  • Loman, Nicholas; University of Birmingham. School of Biosciences. Birmingham. GB
  • Rambaut, Andrew; University of Edinburgh. Institute of Ecology and Evolution. Edinburgh. GB
  • Faria, Nuno R.; Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina. Instituto de Medicina Tropical de São Paulo. São Paulo. BR
  • Figueiredo-Mello, Claudia; Instituto de Infectologia Emílio Ribas. São Paulo. BR
  • Sabino, Ester Cerdeira; Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina. Instituto de Medicina Tropical de São Paulo. São Paulo. BR
Rev. Inst. Med. Trop. São Paulo (Online) ; 64: e48, 2022. graf
Article em En | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1387335
Biblioteca responsável: BR1.1
ABSTRACT
ABSTRACT Monkeypox virus (MPXV), a zoonotic virus endemic to the African continent, has been reported in 33 non-endemic countries since May 2022. We report an almost complete genome of the first confirmed case of MPXV in Brazil. Shotgun metagenomic sequencing was completed in 18 hours, from DNA extraction to consensus sequence generation.
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Texto completo: 1 Base de dados: LILACS País/Região como assunto: America do sul / Brasil Idioma: En Revista: Rev. Inst. Med. Trop. São Paulo (Online) Assunto da revista: Medicina Tropical Ano de publicação: 2022 Tipo de documento: Article / Project document País de afiliação: Brasil / Reino Unido
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